====== OpenBabel et Jmol ======
===== OpenBabel =====
[[http://fr.wikipedia.org/wiki/OpenBabel|OpenBab... puler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.
* Site officiel... stall.html|celle-ci]] (lien avec python).
===== Jmol =====
[[http://fr.wikipedia.org/wiki/Jmol|Jmol]] est un logiciel libre de visualisation de structures
gorithmes sur entiers]], où on parle d'atomes, de molécules, de nombres de nucléons !
* [[algos_diver... sur les éléments chimiques)
* [[rdkit|RDKit et molécules]] (représentation,...)
* [[bioinformatic|... quences ADN, ARN, protéines,...)
* [[openbabel_jmol|OpenBabel et Jmol]] : format de description de molécules et visualisations
* [[ChemSpiPy]] : utilisa
ne suivante en disposant de deux variables (t et nmol) :
<code>Au temps = 0.6 heure, la réaction a consommé 1.23 moles de réactif.</code>
On peut obtenir cette ligne ... ('Au temps =%g heure, la réaction a consommé %.2f moles de réactif.' % (t,nmol))</code>
Lors de l'exécution, les symboles '%' rencontrés sont remplacés par
====== Éléments et molécules ======
Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un p... //mendeleev.herokuapp.com/]]
*
===== Librairie Molmass =====
[[http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/|Chr... ity of California, Irvine), a écrit une librairie molmass pour accéder aux propriétés des éléments, et
====== Représentation de molécules ======
Page à actualiser...
Certaines fonctions de ce programme né... sv|bdd.csv}}
<sxh python; title : representation_molecules.py>
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF... e un lien pour vers une visualisation en 3D de la molécule
'''
link="http://chemapps.stolaf.edu/jmol/jmol.php?model="+SMILES
return link
def SMIL
Thom H. , Benchmark calculations with correlated molecular wave functions. IV. The classical barrier h... xchange.com/questions/47665/ballistic-behavior-of-molecules-on-potential-energy-surfaces]]
* [[http:/... Derive, by Themselves, Two-Dimensional Atomic and Molecular Quantum Chemistry from Scratch]], Yingbin G