Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- teaching:progappchim:rdkit [2021/03/03 09:54] – villersd
+++ teaching:progappchim:rdkit [2023/05/27 22:54] (Version actuelle) – villersd
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   * [[http://www.chemspider.com/|ChemSpider | Search and share chemistry]] site reprenant de nombreuses informations sur des molécules
   * ...
+===== Utilisation avec Anaconda =====
+<note warning>
+L'utilisation de RDKit pouvant poser des problèmes de conflits entre des libairies, il peut être utile de créer et activer un environnement spécifique d'Anaconda (nommé par exemple RDKit).
+La librairie rdkit est à installer, en renseignant au préalable le canal "rdkit" dans laquelle Anaconda ira la chercher.
+L'éditeur Spider doit être installé dans chaque nouvel environnement si on souhaite l'utiliser.
+</note>
+===== Utilisation dans Colaboratory =====
+  * Créer une première cellule de code permettant l'installation de RDKIT : <code>!pip install rdkit-pypi</code>
+  * Fichier exemple : {{ :teaching:progappchim:rdkit_primer_01.ipynb |}}
 ===== Exemples d'utilisation =====
@@ Ligne 27: / Ligne 43: @@
 Draw.MolToFile(mol,"caffeine.png",size=(200,250))
 </code>
+===== Références =====
+  * [[wp>Chemistry_Development_Kit|Chemistry Development Kit]]
+  * [[https://www.nextmovesoftware.com/talks/Mayfield_ChemicalDepiction_RDKITUGM_201609.pdf|Higher Quality Chemical Depictions: Lessons Learned and Advice]] John Mayfield, 2016