Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente |
teaching:progappchim:bioinformatic [2021/02/20 23:00] – [Références] villersd | teaching:progappchim:bioinformatic [2022/09/22 16:59] (Version actuelle) – [Références] villersd |
---|
| |
[[https://biopython.org/|Biopython]] est une librairie de programmes en langage Python dédiée à l'étude de séquences (ADN, ARN, protéines). Pour utiliser cette librairie, elle doit-être installée au préalable, par exemple : | [[https://biopython.org/|Biopython]] est une librairie de programmes en langage Python dédiée à l'étude de séquences (ADN, ARN, protéines). Pour utiliser cette librairie, elle doit-être installée au préalable, par exemple : |
* Avec la distribution Anaconda, via l'interface Anaconda-Navigator ou par la commande suivante : conda install -c conda-forge biopython | * Avec la distribution Anaconda, via l'interface Anaconda-Navigator, au départ du canal "conda-forge' ou par la commande suivante : conda install -c conda-forge biopython |
* via le site Pypi (pypi.org) et la commande suivante : pip install biopython | * via le site Pypi (pypi.org) et la commande suivante : pip install biopython |
| |
* [[https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open-source_bioinformatics_software]] | * [[https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open-source_bioinformatics_software]] |
* cours introductif sur biopython : | * cours introductif sur biopython : |
* [[https://www.bits.vib.be/component/content/article?id=176:biopython|Introduction to Biopython]] VIB bioinformatics core, Kristian Rother, en particulier [[https://data.bits.vib.be/pub/trainingen/Biopython/Basics_of_Biopython_1.1.pdf|ce tutoriel]] | * [[https://bioinformaticscore.sites.vib.be/en|VIB bioinformatics core]], en particulier [[https://data.bits.vib.be/pub/trainingen/Biopython/Basics_of_Biopython_1.1.pdf|ce tutoriel]] |
* [[https://www.bioinformaticsalgorithms.org/|Bioinformatics Algorithms]] | * [[https://www.bioinformaticsalgorithms.org/|Bioinformatics Algorithms]] |
* Articles de la revue "Science in School" : | * Articles de la revue "Science in School" : |