Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
| teaching:progappchim:openbabel_jmol [2014/02/27 22:29] – [Exemple de programme Python] villersd | teaching:progappchim:openbabel_jmol [2022/03/14 17:28] (Version actuelle) – [Jmol] villersd | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 5: | Ligne 5: | ||
| * Site officiel : [[http:// | * Site officiel : [[http:// | ||
| * Interfaçage en Python : [[http:// | * Interfaçage en Python : [[http:// | ||
| + | |||
| + | Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu, | ||
| ===== Jmol ===== | ===== Jmol ===== | ||
| Ligne 11: | Ligne 13: | ||
| C'est un programme idéal pour visualiser des molécules dont les fichiers de description ont été obtenus par OpenBabel (ou d' | C'est un programme idéal pour visualiser des molécules dont les fichiers de description ont été obtenus par OpenBabel (ou d' | ||
| - | * Site officiel : [[http:// | + | * Site officiel : [[http:// |
| ===== Exemple de programme Python ===== | ===== Exemple de programme Python ===== | ||
| - | <sxh python; title : generate_alcohols-01.py> | + | <code python generate_alcohols-01.py> |
| #! / | #! / | ||
| # -*- coding: utf-8 -*- | # -*- coding: utf-8 -*- | ||
| Ligne 91: | Ligne 93: | ||
| print ' | print ' | ||
| - | </sxh> | + | </code> |
| Pour le méthanol, ce programme sort ces informations : | Pour le méthanol, ce programme sort ces informations : | ||
| < | < | ||
| Ligne 104: | Ligne 107: | ||
| partial charges = (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4) | partial charges = (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4) | ||
| total charge = 0 | total charge = 0 | ||
| - | |||
| </ | </ | ||
| + | |||
| + | ===== References ===== | ||
| + | * [[http:// | ||
| + | * [[http:// | ||