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teaching:progappchim:openbabel_jmol

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teaching:progappchim:openbabel_jmol [2014/02/27 22:29]
villersd [Exemple de programme Python]
teaching:progappchim:openbabel_jmol [2015/06/16 12:28] (Version actuelle)
villersd [References]
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   * Site officiel : [[http://​openbabel.org/​wiki/​Main_Page]]   * Site officiel : [[http://​openbabel.org/​wiki/​Main_Page]]
   * Interfaçage en Python : [[http://​openbabel.org/​wiki/​Python]]   * Interfaçage en Python : [[http://​openbabel.org/​wiki/​Python]]
 +
 +Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,​...),​ installer les paquets openbabel et python-openbabel. Sous Windows, voir [[http://​openbabel.org/​docs/​dev/​Installation/​install.html|cette page]], et [[http://​openbabel.org/​docs/​2.3.1/​UseTheLibrary/​PythonInstall.html|celle-ci]] (lien avec python).
  
 ===== Jmol ===== ===== Jmol =====
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 partial charges =  (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4) partial charges =  (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4)
 total charge =  0 total charge =  0
- 
 </​code>​ </​code>​
 +
 +===== References =====
 +  * [[http://​www.jcheminf.com/​content/​3/​1/​33|Open Babel: An open chemical toolbox]], Noel M O'​Boyle,​ Michael Banck, Craig A James, Chris Morley, Tim Vandermeersch and Geoffrey R Hutchison, Journal of Cheminformatics 2011, 3:33  doi:​10.1186/​1758-2946-3-33
 +  * [[http://​www.jcheminf.com/​content/​7/​1/​23/​abstract|InChI,​ the IUPAC International Chemical Identifier]] Stephen R Heller, Alan McNaught, Igor Pletnev, Stephen Stein and Dmitrii Tchekhovskoi,​ Journal of Cheminformatics 2015, 7:23 doi:​10.1186/​s13321-015-0068-4
teaching/progappchim/openbabel_jmol.1393536574.txt.gz · Dernière modification: 2014/02/27 22:29 par villersd