teaching:progappchim:openbabel_jmol

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teaching:progappchim:openbabel_jmol [2014/02/27 22:29] – [Exemple de programme Python] villersdteaching:progappchim:openbabel_jmol [2015/06/16 12:28] – [References] villersd
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   * Site officiel : [[http://openbabel.org/wiki/Main_Page]]   * Site officiel : [[http://openbabel.org/wiki/Main_Page]]
   * Interfaçage en Python : [[http://openbabel.org/wiki/Python]]   * Interfaçage en Python : [[http://openbabel.org/wiki/Python]]
 +
 +Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,...), installer les paquets openbabel et python-openbabel. Sous Windows, voir [[http://openbabel.org/docs/dev/Installation/install.html|cette page]], et [[http://openbabel.org/docs/2.3.1/UseTheLibrary/PythonInstall.html|celle-ci]] (lien avec python).
  
 ===== Jmol ===== ===== Jmol =====
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 partial charges =  (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4) partial charges =  (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4)
 total charge =  0 total charge =  0
- 
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 +
 +===== References =====
 +  * [[http://www.jcheminf.com/content/3/1/33|Open Babel: An open chemical toolbox]], Noel M O'Boyle, Michael Banck, Craig A James, Chris Morley, Tim Vandermeersch and Geoffrey R Hutchison, Journal of Cheminformatics 2011, 3:33  doi:10.1186/1758-2946-3-33
 +  * [[http://www.jcheminf.com/content/7/1/23/abstract|InChI, the IUPAC International Chemical Identifier]] Stephen R Heller, Alan McNaught, Igor Pletnev, Stephen Stein and Dmitrii Tchekhovskoi, Journal of Cheminformatics 2015, 7:23 doi:10.1186/s13321-015-0068-4
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  • Dernière modification : 2022/03/14 17:28
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