Librairie Mendeleev

La librairie Mendeleev est complète et évoluée

• Package repository sur PyPI : https://pypi.org/project/mendeleev/
• Page officielle, description et code source : https://github.com/lmmentel/mendeleev
• Documentation complète : https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/
  • Tutoriels : https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/tutorials.html
• Notebook Jupyter (exemples) :
  • https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/source/notebooks/01_intro_to_mendeleev.ipynb (tutoriel introductif)
  • https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/source/notebooks/02_tables.ipynb (accessing the data in bulk)
  • https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/source/notebooks/03_plotting.ipynb (plotting tutorial)
• Installation via pip, ou la commande conda, ou l'interface de Anaconda, suivant l'environnement utilisé :
  • pip install –user mendeleev
  • conda install -c conda-forge mendeleev=0.5.2
  • conda install -c lmmentel mendeleev=0.6.1 (version plus récente)

• Données utilisables, en ligne : http://mendeleev.herokuapp.com/

• Créer une première cellule de code permettant l'installation de la librairie mendeleev :

  !pip install mendeleev

• Fichier exemple : mendeleev_primer_01.ipynb

IonizationEnergy-01.py

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
 
"""
Library references :
  * https://pypi.org/project/mendeleev/
  * https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/
  * https://github.com/lmmentel/mendeleev
"""
from mendeleev import element
import matplotlib.pyplot as plt
 
x, y = range(1,108), [element(i).ionenergies[1] for i in range(1,108)]
for i in range(1,108):
    print(x[i-1], y[i-1])
 
plt.figure()
plt.plot(x, y)
plt.savefig("ionenergies.png")
plt.show()

boiling-melting-temperatures-01.py

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
 
"""
Library references :
  * https://pypi.org/project/mendeleev/
  * https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/
  * https://github.com/lmmentel/mendeleev
"""
from mendeleev import element
 
# on peut accéder aux valeurs en utilisant le symbole de l'élément
print(element('Na').atomic_number)
print(element('Na').melting_point)
print(element('Na').boiling_point)
 
# on peut aussi accéder aux mêmes valeurs par nombre atomique
print(element(11).melting_point, element(11).boiling_point)
 
# On peut parcourir une liste d'éléments, par exemple les 18 premiers 
for atnum in range(1, 19):
    print(element(atnum).atomic_number,
          element(atnum).symbol,
          element(atnum).name,
          element(atnum).melting_point,
          element(atnum).boiling_point,
          )

elements-names-01.py

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Fri Jan  8 19:11:22 2021
 
@author: villersd
"""
import string
from mendeleev import element
print(list(range(6)))
for ele in element([1, 2, 3, 4, 5, 6]):
    print(ele.name)
 
for ele in element(list(range(1,119))):
    print(ele.symbol,)
 
symbols = [element(i).symbol for i in range(1,119)]
print(symbols)
 
# recherche de lettres non utilisées pour des symboles chimiques à une seule
# letre
# https://docs.python.org/release/3.8.5/library/string.html
print(string.ascii_uppercase)
nonsymbols = [U for U in string.ascii_uppercase if U not in symbols]
print(nonsymbols)

Application : intégrer les parties de code suivante dans un notebook, après avoir installé la librairie mendeleev :

from mendeleev import element
for Z in range(1,19):
    print(Z,element(Z))

from mendeleev import get_table
ptable = get_table('elements')
ptable.info()

cols = ['atomic_number', 'symbol', 'name', 'atomic_radius', 'covalent_radius_pyykko', 'en_pauling']
ptable[cols].head(19)

type(ptable)
ptable.plot(x='atomic_number', y='covalent_radius_pyykko')

• Un tableau périodique avec le module Python “mendeleev” David Alberto
  • Voir aussi :
    • le package LaTeX pgf-PeriodicTable
    • Tableau Périodique en Français, Anglais et Espagnol par Fernando S. Delgado Trujillo