teaching:progappchim:epidemie_coronavirus

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 ===== Programmes de représentations ===== ===== Programmes de représentations =====
 FIXME FIXME
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 +Quelques simulations SEIR effectuées par des scientifiques :
 +  * Nicolas Vandewalle (ULiège, thermodynamique statistique) [[https://twitter.com/vdwnico]]
 +  * [[https://twitter.com/T_Fiolet/status/1239658681995796485]]
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 ===== Simulations numériques ===== ===== Simulations numériques =====
  
-FIXME : master équation de Pauli (relaxation collisionnelle) et applicabilité (et limitation) aux épidémies...+Quelques modèles simplifiés sont analogues de schémas réactionnels en chimie (réactions en chaîne notamment). Des approches déterministes permettent d'obtenir des systèmes d'équations différentielles ordinaires assez simples. Par exemple le modèle SEIR : Susceptible, Exposed ("porteur contaminé, sain, en incubation), Infectious (contagieux), Recovered (guéri). La mortalité due à la maladie n'est pas considérée dans ce modèle simplifié. 
 +  * modèle SIR = modèle encore plus simple 
 +  * [[https://en.wikipedia.org/wiki/Compartmental_models_in_epidemiology#The_SEIR_model|SEIR model]] 
 +  * [[http://www.modelinginfectiousdiseases.org/]] 
 +    * [[http://homepages.warwick.ac.uk/~masfz/ModelingInfectiousDiseases/Chapter2/Program_2.6/index.html|chapitre 2, programme 2.6]] 
 +  * [[https://www.nature.com/articles/s41421-020-0148-0|Phase-adjusted estimation of the number of Coronavirus Disease 2019 cases in Wuhan, China]] → paramètres pour le COVID-19 
 +  * paramètres FIXME 
 +    * average incubation period a 
 +    * transmission rate : β 
 +    * infection rate : σ →  1/a = 1/5.2 
 +    * recovery rate : γ → 1/18 
 +    * le "basic reproduction number" R0 (approximativement β/γ ??) → 2.6 ?? 
 +    * natalité et mortalité de base négligée dans l'article utilisé 
 +  * valeurs initiales (par exemple) : 
 +    * S = 11 millions 
 +    * E = 20 * I 
 +    * I = 40 
 +    * R = 0 
 +  * lien à d'autres nombres : 
 +    * basic reproduction number 
 + 
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 +La relaxation collisionnelle, traitée par la "master équation de Pauli" pourrait être comparée, voire appliquée aux épidémies.
  
 ===== Représentations et simulations existantes ===== ===== Représentations et simulations existantes =====
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   * [[https://towardsdatascience.com/coronavirus-data-visualizations-using-plotly-cfbdb8fcfc3d|Coronavirus data visualizations using Plotly]]   * [[https://towardsdatascience.com/coronavirus-data-visualizations-using-plotly-cfbdb8fcfc3d|Coronavirus data visualizations using Plotly]]
   * Modèle SEIR appliqué à l'épidémie en Chine : [[https://www.nature.com/articles/s41421-020-0148-0|Phase-adjusted estimation of the number of Coronavirus Disease 2019 cases in Wuhan, China]] Wang, H., Wang, Z., Dong, Y. et al.  Cell Discov 6, 10 (2020) DOI: 10.1038/s41421-020-0148-0   * Modèle SEIR appliqué à l'épidémie en Chine : [[https://www.nature.com/articles/s41421-020-0148-0|Phase-adjusted estimation of the number of Coronavirus Disease 2019 cases in Wuhan, China]] Wang, H., Wang, Z., Dong, Y. et al.  Cell Discov 6, 10 (2020) DOI: 10.1038/s41421-020-0148-0
 +  * [[http://gabgoh.github.io/COVID/index.html]]
 +    * [[https://github.com/gabgoh/gabgoh.github.io/tree/master/COVID]]
 +  * [[https://cream.io/|COVID Rules Everything Around Me]] Understand COVID growth rates between different countries
  
 ===== Références ===== ===== Références =====
  • teaching/progappchim/epidemie_coronavirus.txt
  • Dernière modification : 2020/07/13 04:04
  • de villersd