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| teaching:progappchim:bioinformatic [2020/03/30 10:56] – villersd | teaching:progappchim:bioinformatic [2020/06/15 01:18] – [Références] villersd |
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| * [[https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open-source_bioinformatics_software]] | * [[https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open-source_bioinformatics_software]] |
| * cours introductif sur biopython : | * cours introductif sur biopython : |
| * [[https://www.bits.vib.be/component/content/article?id=176:biopython|Introduction to Biopython]] VIB bioinformatics core, Kristian Rother * [[http://www.scienceinschool.org/2014/issue29/online_bioinf|Using biological databases to teach evolution and biochemistry]] | * [[https://www.bits.vib.be/component/content/article?id=176:biopython|Introduction to Biopython]] VIB bioinformatics core, Kristian Rother, en particulier [[https://data.bits.vib.be/pub/trainingen/Biopython/Basics_of_Biopython_1.1.pdf|ce tutoriel]] |
| | * [[https://www.bioinformaticsalgorithms.org/|Bioinformatics Algorithms]] |
| * Articles de la revue "Science in School" : | * Articles de la revue "Science in School" : |
| * [[https://www.scienceinschool.org/2010/issue17/bioinformatics|Bioinformatics with pen and paper: building a phylogenetic tree]] Cleopatra Kozlowski, 07/12/2010 | * [[https://www.scienceinschool.org/2010/issue17/bioinformatics|Bioinformatics with pen and paper: building a phylogenetic tree]] Cleopatra Kozlowski, 07/12/2010 |
| * documentation sur les arbres phylogénétiques : [[https://biopython.org/wiki/Phylo]] | * documentation sur les arbres phylogénétiques : [[https://biopython.org/wiki/Phylo]] |
| * [[http://rosalind.info/|Rosalind]], plateforme d'apprentissage de la programmation en bioinformatique | * [[http://rosalind.info/|Rosalind]], plateforme d'apprentissage de la programmation en bioinformatique |
| | * [[http://rosalind.info/glossary/|Glossaire de bioinformatique]] |
| * [[https://stepik.org/catalog?language=en&q=bioinformatics|Catalog – Stepik]] cours et challenges en programmation, avec des activités en bioinformatique | * [[https://stepik.org/catalog?language=en&q=bioinformatics|Catalog – Stepik]] cours et challenges en programmation, avec des activités en bioinformatique |
| * [[https://stepik.org/course/2/promo|Bioinformatics Algorithms – Stepik]] (cours introductif) | * [[https://stepik.org/course/2/promo|Bioinformatics Algorithms – Stepik]] (cours introductif) |
| * [[https://stepik.org/course/4377/promo|Bioinformatics Contest 2018 – Stepik]] concours de programmation 2018 | * [[https://stepik.org/course/4377/promo|Bioinformatics Contest 2018 – Stepik]] concours de programmation 2018 |
| * [[https://stepik.org/course/43615/promo|Bioinformatics Contest 2019 – Stepik]] concours de programmation 2019 | * [[https://stepik.org/course/43615/promo|Bioinformatics Contest 2019 – Stepik]] concours de programmation 2019 |
| * [[http://www.amberbiology.com/]] & [[https://pythonforthelifesciences.com/|Python for the Life Sciences – A gentle introduction to Python for life scientists]] (livre) | * [[http://www.amberbiology.com/]] & [[https://pythonforthelifesciences.com/|Python for the Life Sciences – A gentle introduction to Python for life scientists]] programmation privilégiant les modules standards de Python (pas le module biopython par exemple) |
| * [[https://www.packtpub.com/eu/application-development/bioinformatics-python-cookbook|Bioinformatics with Python Cookbook]] (livre) | * [[https://www.packtpub.com/eu/application-development/bioinformatics-python-cookbook|Bioinformatics with Python Cookbook]] livre utilisant beaucoup la librairie biopython |
| * [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/|GenBank]] | * [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/|GenBank]] |
| * références sur la lecture de fichiers : | * références sur la lecture de fichiers : |