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teaching:progappchim:bioinformatic

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   * [[https://​en.wikipedia.org/​wiki/​List_of_open-source_bioinformatics_software]]   * [[https://​en.wikipedia.org/​wiki/​List_of_open-source_bioinformatics_software]]
   * cours introductif sur biopython :   * cours introductif sur biopython :
-    * [[https://​www.bits.vib.be/​component/​content/​article?​id=176:​biopython|Introduction to Biopython]] VIB bioinformatics core, Kristian Rother ​ ​* ​[[http://www.scienceinschool.org/2014/issue29/online_bioinf|Using biological databases to teach evolution and biochemistry]]+    * [[https://​www.bits.vib.be/​component/​content/​article?​id=176:​biopython|Introduction to Biopython]] VIB bioinformatics core, Kristian Rother, en particulier ​[[https://data.bits.vib.be/pub/trainingen/Biopython/​Basics_of_Biopython_1.1.pdf|ce tutoriel]]
   * Articles de la revue "​Science in School"​ :   * Articles de la revue "​Science in School"​ :
     * [[https://​www.scienceinschool.org/​2010/​issue17/​bioinformatics|Bioinformatics with pen and paper: building a phylogenetic tree]] Cleopatra Kozlowski, 07/12/2010     * [[https://​www.scienceinschool.org/​2010/​issue17/​bioinformatics|Bioinformatics with pen and paper: building a phylogenetic tree]] Cleopatra Kozlowski, 07/12/2010
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   * documentation sur les arbres phylogénétiques : [[https://​biopython.org/​wiki/​Phylo]]   * documentation sur les arbres phylogénétiques : [[https://​biopython.org/​wiki/​Phylo]]
   * [[http://​rosalind.info/​|Rosalind]],​ plateforme d'​apprentissage de la programmation en bioinformatique   * [[http://​rosalind.info/​|Rosalind]],​ plateforme d'​apprentissage de la programmation en bioinformatique
 +    * [[http://​rosalind.info/​glossary/​|Glossaire de bioinformatique]]
   * [[https://​stepik.org/​catalog?​language=en&​q=bioinformatics|Catalog – Stepik]] cours et challenges en programmation,​ avec des activités en bioinformatique   * [[https://​stepik.org/​catalog?​language=en&​q=bioinformatics|Catalog – Stepik]] cours et challenges en programmation,​ avec des activités en bioinformatique
     * [[https://​stepik.org/​course/​2/​promo|Bioinformatics Algorithms – Stepik]] (cours introductif)     * [[https://​stepik.org/​course/​2/​promo|Bioinformatics Algorithms – Stepik]] (cours introductif)
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     * [[https://​stepik.org/​course/​4377/​promo|Bioinformatics Contest 2018 – Stepik]] concours de programmation 2018     * [[https://​stepik.org/​course/​4377/​promo|Bioinformatics Contest 2018 – Stepik]] concours de programmation 2018
     * [[https://​stepik.org/​course/​43615/​promo|Bioinformatics Contest 2019 – Stepik]] ​ concours de programmation 2019     * [[https://​stepik.org/​course/​43615/​promo|Bioinformatics Contest 2019 – Stepik]] ​ concours de programmation 2019
-  * [[http://​www.amberbiology.com/​]] & [[https://​pythonforthelifesciences.com/​|Python for the Life Sciences – A gentle introduction to Python for life scientists]] (livre+  * [[http://​www.amberbiology.com/​]] & [[https://​pythonforthelifesciences.com/​|Python for the Life Sciences – A gentle introduction to Python for life scientists]] ​programmation privilégiant les modules standards de Python ​(pas le module biopython par exemple
-  * [[https://​www.packtpub.com/​eu/​application-development/​bioinformatics-python-cookbook|Bioinformatics with Python Cookbook]] ​(livre)+  * [[https://​www.packtpub.com/​eu/​application-development/​bioinformatics-python-cookbook|Bioinformatics with Python Cookbook]] livre utilisant beaucoup la librairie biopython
   * [[http://​www.ncbi.nlm.nih.gov/​genbank/​|GenBank]]   * [[http://​www.ncbi.nlm.nih.gov/​genbank/​|GenBank]]
   * références sur la lecture de fichiers :   * références sur la lecture de fichiers :
teaching/progappchim/bioinformatic.txt · Dernière modification: 2020/06/15 01:18 par villersd