Différences
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teaching:progappchim:bioinformatic [2019/03/21 13:45] – [Compter les nucléotides d'une séquence ADN] villersd | teaching:progappchim:bioinformatic [2020/03/27 11:55] – villersd | ||
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+ lecture de fichier | + lecture de fichier | ||
- | <sxh python; title : Finding_a_Protein_Motif-01.py> | + | <code python Finding_a_Protein_Motif-01.py> |
# | # | ||
# -*- coding: utf-8 -*- | # -*- coding: utf-8 -*- | ||
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" | " | ||
- | aminoacids = '' | + | aminoacids = '' |
- | print aminoacids | + | print(aminoacids) |
# UniProt Protein Database access IDs | # UniProt Protein Database access IDs | ||
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seq_record = SeqIO.read(handle, | seq_record = SeqIO.read(handle, | ||
handle.close() | handle.close() | ||
- | + | print() | |
- | print seq_record | + | print(seq_record) |
- | </sxh> | + | </code> |
===== Références ===== | ===== Références ===== | ||
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* [[http:// | * [[http:// | ||
* [[http:// | * [[http:// | ||
+ | * Articles de la revue " | ||
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+ | * [[https:// | ||
+ | * documentation sur les arbres phylogénétiques : [[https:// | ||
+ | * cours introductif sur biopython : | ||
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