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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:openbabel_jmol</title>
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        <description>OpenBabel et Jmol

OpenBabel

OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.

	*  Site officiel : &lt;http://openbabel.org/wiki/Main_Page&gt;
	*  Interfaçage en Python : &lt;http://openbabel.org/wiki/Python&gt;

Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:representation_molecules_2013?rev=1583761370&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:representation_molecules_2013</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:representation_molecules_2013?rev=1583761370&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation de molécules

Page à actualiser...

Certaines fonctions de ce programme nécessite des fichiers de données : [base.csv] et [bdd.csv]
&lt;sxh python; title : representation_molecules.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-
# travail de RL, ba2 chimie 2012-2013</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:analyse_images?rev=1615285540&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:analyse_images</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:analyse_images?rev=1615285540&amp;do=diff</link>
        <description>Analyse d&#039;images

Le traitement d&#039;images permet de transformer des images. L&#039;analyse d&#039;images permet d&#039;extraire des informations contenues dans une image. Il est aussi possible d&#039;effectuer des tâches plus complexes de reconnaissance et d&#039;analyse de scènes.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:start?rev=1678698865&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:start</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:start?rev=1678698865&amp;do=diff</link>
        <description>Programmation appliquée à la chimie
&lt;https://lukasz.langa.pl/f15a8851-af26-4e94-a4b1-c146c57c9d20/&gt;
Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !!

Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:osm_interrogation?rev=1421325514&amp;do=diff">
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        <dc:date>2015-01-15T13:38:34+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:osm_interrogation</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:osm_interrogation?rev=1421325514&amp;do=diff</link>
        <description>Interrogation de la base de données géolocalisées OpenStreetMap

API OSM en Python

	*  Application Programming Interface, en Python

Installation via pip : 

pip(3) install osmapi

Exemple de code

Recherche de débit de boissons (“pub”) via la base de données d&#039;OpenStreetMap.

&lt;sxh  python; title : pub_search_OsmApi.py&gt;
#!/usr/bin/python
# -*- coding: UTF-8 -*-</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:epidemie_coronavirus?rev=1594605869&amp;do=diff">
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        <dc:date>2020-07-13T04:04:29+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:epidemie_coronavirus</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:epidemie_coronavirus?rev=1594605869&amp;do=diff</link>
        <description>Épidémie du coronavirus COVID-19

Références :

	*  Coronavirus disease 2019
	*  Maladie à coronavirus 2019
	*  Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE
	*  Coronavirus (COVID-19) Mortality Rate
	*  data : &lt;https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/tree/master/csse_covid_19_data&gt;

Programmes de représentations

FIXME

Quelques simulations SEIR effectuées par des scientifiques :

	*  Marius Gilbert (ULB/FNRS, Spatial Epidemiology lab (SpELL), &lt;https://twitter.com/mariusgilbert/sta…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_fondamentales?rev=1683095960&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-05-03T08:39:20+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:notions_fondamentales</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_fondamentales?rev=1683095960&amp;do=diff</link>
        <description>Notions fondamentales

Aide mémoire synthétique sur le langage Python.

Règles de base

Ces règles peuvent être testées via le mode interactif de Python (en utilisant la fenêtre “Shell” ou console de l&#039;éditeur Idle ou Idle3 par exemple).</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph_acides_bases_2013?rev=1385720173&amp;do=diff">
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        <dc:date>2013-11-29T11:16:13+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:ph_acides_bases_2013</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph_acides_bases_2013?rev=1385720173&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation de pH d&#039;acides et de bases

Pour les acides :

&lt;sxh python; title : representation_pH_acide.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# travail de QD et TB, ba2 chimie 2012-2013

import Tkinter as tk
from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-09-22T16:59:55+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:bioinformatic</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff</link>
        <description>Bioinformatique

Un des objectifs majeurs de la bioinformatique réside dans l&#039;étude automatique de séquences, principalement de l&#039;ADN et de protéines,...

Ces séquences sont accessibles librement et publiquement, notamment par ces deux sources :

Voir aussi le site</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012?rev=1385724811&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2013-11-29T12:33:31+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012?rev=1385724811&amp;do=diff</link>
        <description>Calul matriciel

&lt;sxh python; title : calcul_matriciel.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-
#&lt;http://www.siteduzero.com/tutoriel-3-223267-apprenez-a-programmer-en-python.html&gt; (pdf)
#&lt;http://stackoverflow.com/questions/455612/python-limiting-floats-to-two-decimal-points&gt;
#pour operation matriciel verification mathématique : &lt;http://fr.wikipedia.org/wiki/Wikip%C3%A9dia:Accueil_principal&gt;
#&lt;http://www.pythonfrance.com/codes/OPERATION-MATRICIELLE_48359.aspx&gt;
#&lt;http://inforef.be/swi/pyt…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:csv?rev=1613035140&amp;do=diff">
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        <dc:date>2021-02-11T10:19:00+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:csv</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:csv?rev=1613035140&amp;do=diff</link>
        <description>Lire et écrire des fichiers de données csv
pandas
Les fichiers csv sont des fichiers de données séparées par des virgules (ou point-virgules), pour “comma separated values”. Comme ceci :


1;0.1;3
2;0.3;5
3;0.5;7
4;0.6;11
5;0.9;21
6;1.5;39


Ils peuvent être facilement importés ou exportés de tableurs ou logiciels de graphiques scientifiques.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fizz_buzz?rev=1488288903&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:fizz_buzz</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fizz_buzz?rev=1488288903&amp;do=diff</link>
        <description>Fizz buzz

Fizz buzz est un jeu de comptage et de divisibilité conçu pour des enfants. Les joueurs comptent à tour de rôle en incrémentant, partant de 1, et remplaçant chaque nombre divisible par 3 par le mot “fizz”, et chaque mot divisible par 5 par le mot</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_simple?rev=1689054396&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:matplotlib_simple</title>
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        <description>Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D

Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:presentation_principes</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff</link>
        <description>~~REVEAL transition=convex&amp;controls=1&amp;show_progress_bar=1&amp;build_all_lists=1&amp;open_in_new_window=1~~

Programmer en Python

Généralités

	*  Qu&#039;est-ce qu&#039;un langage de programmation ?
	*  Compilation ou interprétation, ou... ?

Rôle des langages de programmation</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:algos_entiers</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff</link>
        <description>Algorithmes sur entiers
cf.......
Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie.

Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur)

Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d&#039;entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L&#039;algorithme d&#039;Euclide décompose ce re…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:glossaire_chimie?rev=1556532830&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:glossaire_chimie</title>
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        <description>Glossaire de chimie

Cf. le glossaire de chimie


#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Utilisation du glossaire https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:glossaire-chimie
Le code dokuwiki source doit être sauvegardé dans un fichier glossaire-dokuwiki.txt

Programme de base à modifier/compléter.
&quot;&quot;&quot;
from pathlib import Path
home = str(Path.home())

# fichier d&#039;entrée
with open(home + &quot;/tempo/glossaire-dokuwiki.txt&quot;, &quot;r&quot;) as ifile:
    lines = ifile.readlines()
    ifile.close()    …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-06-10T08:56:04+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:jupyter</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff</link>
        <description>Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab

	*  Jupyter a succédé à IPython Notebook
	*  Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C&#039;est la manière la plus adéquate d&#039;utiliser Jupyter.
	*  Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:multilateration?rev=1690514475&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-07-28T05:21:15+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:multilateration</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:multilateration?rev=1690514475&amp;do=diff</link>
        <description>Multilateration

Références

	*  &lt;https://pypi.org/project/Localization/&gt;
		*  &lt;https://github.com/kamalshadi/Localization&gt;
		*  dépendance : &lt;https://pypi.org/project/shapely/&gt;

	*  Trilateration
	*  True-range multilateration
	*  &lt;https://math.stackexchange.com/questions/2329756/how-to-convert-distances-among-dots-to-coordinate&gt;
	*  &lt;https://stackoverflow.com/questions/9747227/2d-trilateration&gt;
	*  &lt;https://stackoverflow.com/questions/23400351/localizing-a-point-using-distances-to-three-other-…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_avancees?rev=1683016596&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-05-02T10:36:36+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:notions_avancees</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_avancees?rev=1683016596&amp;do=diff</link>
        <description>Notions avancées

En construction. Les liens sont juste donnés. Une introduction et un exemple devrait être proposé pour chaque rubrique, et le nombre de ces rubriques augmenté.

Itérateurs

Itertools, zip,...

	*  7 Levels of Using the Zip Function in Python
	*  itertools.cycle() est une méthode utile pour répéter ou parcourir sans fin les éléments d&#039;une liste ou d&#039;une table itérativitertools.accumulate()</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plotly_simple?rev=1683016725&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-05-02T10:38:45+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:plotly_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plotly_simple?rev=1683016725&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de Plotly

Plotly (&lt;https://Plot.ly&gt; est une société développant des outils analytiques et de visualisation. La librairie python Plotly permet de créer des graphes dans l&#039;environnement de Jupyter. FIXME : à compléter

Références

	*  plot.ly, le site officiel</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux?rev=1457103767&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2016-03-04T16:02:47+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux?rev=1457103767&amp;do=diff</link>
        <description>Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux

&lt;sxh  python; title : pressions_partielles_systemes_non_ideaux.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“
Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux
Basé sur le travail de ML et VM, ba2 chimie 2013-2014</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:solubilite_ph_t?rev=1457101472&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2016-03-04T15:24:32+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:solubilite_ph_t</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:solubilite_ph_t?rev=1457101472&amp;do=diff</link>
        <description>Solubilité en fonction du pH et de la température

Interface en ligne de commande et graphiques matplotlib

Nécessite [ce fichier de données] (à décompresser).

&lt;sxh  python; title : evolution_solubilite_pH_T.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tableau_periodique_2013?rev=1586858596&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2020-04-14T12:03:16+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:tableau_periodique_2013</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tableau_periodique_2013?rev=1586858596&amp;do=diff</link>
        <description>Tableau périodique

Tableau avec éléments cliquables pour obtenir les information. Nécessite [ce fichier de données].


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# version un peu aménagée du travail de TD et SD, ba2 chimie 2012-2013
 
def elem(x):
    # print type(x),x # pour montrer que x est une chaîne de caractères
    element=Tk()
    element.title(&quot;Propriété du&quot;+ x )
    elembox=Listbox(element,height=32,width=40,fg=&quot;#070942&quot;)
    elembox.pack()
    for item in table[int(x)]:  
        …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-05-12T10:04:44+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff</link>
        <description>Spectre IR du CO

Différentes techniques de spectroscopie utilisent des représentations standardisées des spectres. En spectroscopie Infrarouge, l&#039;absorbance est traditionnellement représentée en fonction des nombres d&#039;ondes décroissants exprimés en $cm^{-1}$. Pour rappel, en spectroscopie, le $\tilde{\nu}$$\tilde{\nu} = 1/\lambda = \nu/c$$\Delta J = \pm 1$$cm^{-1}$</description>
    </item>
</rdf:RDF>
