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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <description>Initiation à l&#039;informatique

Cours libre en ligne à destination des étudiants de la section chimie. Si vous avez des questions ou souhaits de compléments d&#039;informations, ou d&#039;ajouts de rubriques, vous pouvez utiliser ce formulaire de contact.

Les bases de l&#039;informatique</description>
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        <description>Ressources pour la création de séquences vidéos et l&#039;enseignement à distance

Conseils généraux pour la conception

	*  conseils, longueurs, styles,...
		*  Planifier, réaliser et diffuser des vidéos éducatives : lignes directrices et astuces pour les enseignants, Caroline Cormier, Edward Awad, Yann Brouillette et Véronique Turcotte (canada). Article reprenant des exemples de capsule en chimie (</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:mendeleev</title>
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        <description>Librairie Mendeleev

La librairie Mendeleev est complète et évoluée

	*  Package repository sur PyPI : &lt;https://pypi.org/project/mendeleev/&gt;
	*  Page officielle, description et code source : &lt;https://github.com/lmmentel/mendeleev&gt;
	*  Documentation complète : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/&gt;
		*  Tutoriels : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/tutorials.html&gt;

	*  Notebook Jupyter (exemples) : 
		*  &lt;https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/sou…</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:elements_molecules</title>
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        <description>Éléments et molécules

Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:jupyter</title>
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        <description>Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab

	*  Jupyter a succédé à IPython Notebook
	*  Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C&#039;est la manière la plus adéquate d&#039;utiliser Jupyter.
	*  Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_simple?rev=1689054396&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:matplotlib_simple</title>
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        <description>Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D

Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:chempy?rev=1679311387&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:chempy</title>
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        <description>ChemPy

	*  &lt;https://pypi.org/project/chempy/&gt; : installation et documentation


#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Created on Tue May  4 10:25:51 2021

@author: villersd
Librairie chempy :
https://pypi.org/project/chempy/#documentation
https://github.com/bjodah/chempy
installation Linux : conda install -c bjodah chempy pytest
installation Windows &amp; OS X :
python -m pip install chempy pytest
python -m pytest -rs -W ignore::chempy.ChemPyDeprecationWarning --pyargs chempy
&quot;&quot;&quot;
from …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:adamboxer-approche_pas_a_pas_des_travaux_pratiques?rev=1647510932&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:adamboxer-approche_pas_a_pas_des_travaux_pratiques</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:adamboxer-approche_pas_a_pas_des_travaux_pratiques?rev=1647510932&amp;do=diff</link>
        <description>Approche pas à pas des travaux pratiques

	*  Source : Adam Boxer, RSC Education, 2020 : Take a walk on the slow side - Try this step-by-step approach to practical work and see students’ learning improve
		*  voir aussi : Teaching Secondary Science: A Complete Guide Adam Boxer, John Catt Bookshop, 2021 ISBN: 9781913622787






“”“”“”



Exemple d&#039;une séance de travaux pratiques sur les vitesses de réaction impliquant des éclats de marbre, de l&#039;acide et des seringues à gaz. Voici les étapes à su…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:bioinformatic</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff</link>
        <description>Bioinformatique

Un des objectifs majeurs de la bioinformatique réside dans l&#039;étude automatique de séquences, principalement de l&#039;ADN et de protéines,...

Ces séquences sont accessibles librement et publiquement, notamment par ces deux sources :

Voir aussi le site</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:openbabel_jmol</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff</link>
        <description>OpenBabel et Jmol

OpenBabel

OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.

	*  Site officiel : &lt;http://openbabel.org/wiki/Main_Page&gt;
	*  Interfaçage en Python : &lt;http://openbabel.org/wiki/Python&gt;

Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pandas?rev=1668503305&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:pandas</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pandas?rev=1668503305&amp;do=diff</link>
        <description>Pandas

Module pour l&#039;analyse de données, pouvant se substituer à l&#039;utilisation d&#039;un tableur. Une différence fondamentale de la librairie pandas avec NumPy, c&#039;est que les tableaux NumPy (NumPy arrays) ont le même type (dtype) pour le tableau entier, tandis que les tableaux pandas (pandas DataFrames) sont caractérisés par un type unique (dtype) par colonne.$X$$x$$P(x)$$X$$x$$x_1, x_2, x_3, ...$$X$$P(x_i)$$X$$x$$P(x)$$x$$x+dx$$P(x)$$x$$P(x) dx$$P(x) dx = P(x \le X &lt; x+dx)$$P(x_i) \ge 0$$x_i$$P(x) …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:rdkit?rev=1685220843&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:rdkit</title>
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        <description>RDKit

	*  &lt;http://www.rdkit.org/&gt;
	*  Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation
	*  Depict a compound as an image | Chemistry Toolkit Rosetta Wiki | Fandom
	*  Jupyter &amp; RDKit
		*  Getting Started with RDKit and Jupyter | Depth-First
		*  &lt;http://davies-lee.com/index.php/2018/10/06/rdkit-in-jupyter-notebooks/&gt;

	*  ChemSpider | Search and share chemistry site reprenant de nombreuses informations sur des molécules
	*  ...

Utilisation avec Anaconda

“”



Utili…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:start?rev=1678698865&amp;do=diff">
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        <description>Programmation appliquée à la chimie
&lt;https://lukasz.langa.pl/f15a8851-af26-4e94-a4b1-c146c57c9d20/&gt;
Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !!

Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.8b00133?rev=1567841242&amp;do=diff">
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        <description>Démonstrations chimiques et attention visuelle : La configuration est elle importante? Mise en évidence issue d&#039;une étude du suivi oculaire, en approche double aveugle

Article Chemistry Demonstrations and Visual Attention: Does the Setup Matter? Evidence from a Double-Blinded Eye-Tracking Study Andreas Nehring and Sebastian Busch, J. Chem. Educ., 2018, 95 (10), pp 1724–1735 DOI: 10.1021/acs.jchemed.8b00133 résumé de M.M.M. 2018-2019</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.8b00381?rev=1558611582&amp;do=diff">
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        <dc:date>2019-05-23T13:39:42+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.8b00381</title>
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        <description>Création et expérimentation d&#039;un système robuste et peu coûteux pour démontrer visuellement la pression de vapeur des liquides en fonction de la température

Article : Creating and Experimenting with a Low-Cost, Rugged System to Visually Demonstrate the Vapor Pressure of Liquids as a Function of Temperature Rodrigo Papai, Mayara Araujo Romano, Aline Rodrigues Arroyo, Bárbara Rodrigues da Silva, Bruno Tresoldi, Gabriela Cabo Winter, Julia Messias Costa, Maria Aparecida Freitas Santos, Matheus Dam…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:desinformations?rev=1692843536&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:desinformations</title>
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        <description>Cette page regroupe quelques exemples d&#039;informations et désinformations, notamment tirés de différents media : presse, réseaux sociaux, blogs, forums,... des désinformations, et parfois aussi une information qui se veut plus conforme aux faits.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-02-21T14:56:20+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:presentation_principes</title>
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        <description>~~REVEAL transition=convex&amp;controls=1&amp;show_progress_bar=1&amp;build_all_lists=1&amp;open_in_new_window=1~~

Programmer en Python

Généralités

	*  Qu&#039;est-ce qu&#039;un langage de programmation ?
	*  Compilation ou interprétation, ou... ?

Rôle des langages de programmation</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-01-10T09:04:54+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:algos_entiers</title>
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        <description>Algorithmes sur entiers
cf.......
Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie.

Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur)

Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d&#039;entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L&#039;algorithme d&#039;Euclide décompose ce re…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:analyse_images?rev=1615285540&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2021-03-09T11:25:40+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:analyse_images</title>
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        <description>Analyse d&#039;images

Le traitement d&#039;images permet de transformer des images. L&#039;analyse d&#039;images permet d&#039;extraire des informations contenues dans une image. Il est aussi possible d&#039;effectuer des tâches plus complexes de reconnaissance et d&#039;analyse de scènes.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:grille_configurations_melange_binaire_2013?rev=1385719509&amp;do=diff">
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        <dc:date>2013-11-29T11:05:09+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:grille_configurations_melange_binaire_2013</title>
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        <description>Création d&#039;une grille et de configurations d&#039;un système binaire modélisé

&lt;sxh python; title : grille_configurations_melange_binaire.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# travail de ML et MP, ba2 chimie 2012-2013
# Création d&#039;une grille et de configurations d&#039;un système binaire modélisé</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:osm_interrogation?rev=1421325514&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-01-15T13:38:34+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:osm_interrogation</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:osm_interrogation?rev=1421325514&amp;do=diff</link>
        <description>Interrogation de la base de données géolocalisées OpenStreetMap

API OSM en Python

	*  Application Programming Interface, en Python

Installation via pip : 

pip(3) install osmapi

Exemple de code

Recherche de débit de boissons (“pub”) via la base de données d&#039;OpenStreetMap.

&lt;sxh  python; title : pub_search_OsmApi.py&gt;
#!/usr/bin/python
# -*- coding: UTF-8 -*-</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pubchempy?rev=1647339605&amp;do=diff">
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        <dc:date>2022-03-15T11:20:05+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pubchempy</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pubchempy?rev=1647339605&amp;do=diff</link>
        <description>PubChemPy

	*  Documentation : &lt;https://pubchempy.readthedocs.io/en/latest/index.html&gt;

Utilisation dans Colaboratory

	*  Créer une première cellule de code permettant l&#039;installation de la librairie PubChemPy : 
!pip install pubchempy

	*  Fichier exemple :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.0c00099?rev=1674573391&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-01-24T16:16:31+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.0c00099</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.0c00099?rev=1674573391&amp;do=diff</link>
        <description>Introduction à la chimie médicinale : Un cours de cinq jours pour les élèves du secondaire

Introduction to Medicinal Chemistry: A Five-Day Course for High School Students M. Kyle Hadden and Angela M. Zaino, J. Chem. Educ. 2020, 97, 6, 1543–1548 DOI: 10.1021/acs.jchemed.0c00099 résumé de E.C. 2021-2022

Article d&#039;intérêt dans le domaine pharmaceutique</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.5b00203?rev=1560025570&amp;do=diff">
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        <description>Pourquoi demander pourquoi ?

Article : Why Ask Why? Melanie M. Cooper, J. Chem. Educ., 2015, 92 (8), pp 1273–1279 DOI: 10.1021/acs.jchemed.5b00203 résumé de C.M. 2015-20162015-2016



Sujet

Dans cet article, l’auteur dit qu’il est important d’aider les étudiants à construire des explications mécanistiques et causales des phénomènes, c’est-à-dire, aider les étudiants à utiliser leur compréhension des interactions au niveau moléculaire afin d’expliquer et prédire les événements se produisant au …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-acs.jchemed.6b00844?rev=1560024430&amp;do=diff">
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        <description>Expérience de la bouteille bleue : Apprendre la chimie sans connaître les produits chimiques

Article Blue Bottle Experiment: Learning Chemistry without Knowing the Chemicals  T. Limpanuparb , C. Areekul, P. Montriwat, and U. Rajchakit, J. Chem. Educ., 2017, 94 (6), pp 730–737 DOI: 10.1021/acs.jchemed.6b00844 résumé de F.P. 2017-2018</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-ed078p481?rev=1447080914&amp;do=diff">
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        <description>La chimie dans les films contemporains

Almost Like Weighing Someone’s Soul”: Chemistry in Contemporary Film, Donald J. Wink, J. Chem. Ed.Vol. 78 No. 4 April 2001, pp 481-483. Résumé de V.L., 2009-2010

L’utilisation de courts clips vidéo de différents films populaires constitue un moyen ludique de présenter des exemples « vivants » de théories ou faits importants dans l’enseignement de la chimie. Exemples de films utilisés : Apollo 13, A la poursuite de l’arche perdue, Légende d’automne, the ro…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:biblio-10.1021-ed5001729?rev=1560024711&amp;do=diff">
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        <description>L&#039;oxydation du Fer : Expérimentation, simulation et analyse dans l&#039;introduction de la chimie

Article The Oxidation of Iron: Experiment, Simulation, and Analysis in Introductory Chemistry Frederic E. Schubert, J. Chem. Educ., 2015, 92 (3), pp 517–520 DOI: 10.1021/ed5001729 résumé de S.G. 2015-2016



But

Le but de cet article est de démontrer l&#039;importance de l&#039;oxydation de fer et confronter des données obtenues par expérimentation et par simulation.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:exos_batterie_capacite_densite?rev=1688561260&amp;do=diff">
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        <description>Quelles tailles et capacités de batteries électriques pour assurer l&#039;utilisation d&#039;énergies renouvelables

Le stockage énergétique est nécessaire dans le cadre d&#039;une transition vers 100% d&#039;énergie renouvelable. Si l&#039;énergie hydroélectrique peut être utilisée à volonté (pilotable), ce n&#039;est pas le cas des productions d&#039;électricité via les éoliennes et les panneaux photo-voltaïques qui sont de plus en plus installés.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:timeline-chimie?rev=1619610656&amp;do=diff">
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        <description>Ligne du Temps de la Chimie



Préambule

Toute science progresse par la réalisation et l&#039;interprétation d&#039;expériences, par l&#039;introduction de nouveaux concepts, ... Des améliorations et corrections se succèdent alors, dévoilant parfois des erreurs ou des imprécisions du passé. Dans de nombreuses situations, la recherche scientifique induit des interrogations sur l&#039;articulation des travaux actuels par rapport à la masse des connaissances précédentes. Dès lors, on se rend compte qu&#039;une connaissanc…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:chemspipy?rev=1614770010&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:chemspipy</title>
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        <description>ChemSpiPy

	*  Utilisation des données de ChemSpider
	*  &lt;https://github.com/mcs07/ChemSpiPy&gt; site officiel
	*  &lt;https://chemspipy.readthedocs.io/en/latest/index.html&gt; : documentation officielle
	*  Avec la distribution Anaconda, la lirairie “chemspipy” est installable via le canal “conda-forge”. Utiliser si opportun un environnement spécifique.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-12?rev=1670518165&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:polynomes-12</title>
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        <description>Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy

Voici un programme permettant d&#039;obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l&#039;intérêt d&#039;utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l&#039;importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.</description>
    </item>
</rdf:RDF>
