teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T12:33:31+00:00

Calul matriciel #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- # (pdf) # #pour operation matriciel verification mathématique : # #

teaching:progappchim:matplotlib_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-07-11T07:46:36+00:00

Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :

teaching:progappchim:notions_avancees

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-02T10:36:36+00:00

Notions avancées En construction. Les liens sont juste donnés. Une introduction et un exemple devrait être proposé pour chaque rubrique, et le nombre de ces rubriques augmenté. Itérateurs Itertools, zip,... * 7 Levels of Using the Zip Function in Python * itertools.cycle() est une méthode utile pour répéter ou parcourir sans fin les éléments d'une liste ou d'une table itérativitertools.accumulate()

teaching:progappchim:pandas

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-11-15T10:08:25+00:00

Pandas Module pour l'analyse de données, pouvant se substituer à l'utilisation d'un tableur. Une différence fondamentale de la librairie pandas avec NumPy, c'est que les tableaux NumPy (NumPy arrays) ont le même type (dtype) pour le tableau entier, tandis que les tableaux pandas (pandas DataFrames) sont caractérisés par un type unique (dtype) par colonne.$X$$x$$P(x)$$X$$x$$x_1, x_2, x_3, ...$$X$$P(x_i)$$X$$x$$P(x)$$x$$x+dx$$P(x)$$x$$P(x) dx$$P(x) dx = P(x \le X < x+dx)$$P(x_i) \ge 0$$x_i$$P(x) …

teaching:progappchim:epidemie_coronavirus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-07-13T04:04:29+00:00

Épidémie du coronavirus COVID-19 Références : * Coronavirus disease 2019 * Maladie à coronavirus 2019 * Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE * Coronavirus (COVID-19) Mortality Rate * data : Programmes de représentations FIXME Quelques simulations SEIR effectuées par des scientifiques : * Marius Gilbert (ULB/FNRS, Spatial Epidemiology lab (SpELL),

teaching:progappchim:bioinformatic

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-09-22T16:59:55+00:00

Bioinformatique Un des objectifs majeurs de la bioinformatique réside dans l'étude automatique de séquences, principalement de l'ADN et de protéines,... Ces séquences sont accessibles librement et publiquement, notamment par ces deux sources : Voir aussi le site

teaching:progappchim:game_of_life_conway-2012

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-09T11:29:49+00:00

Jeu de la vie de Conway Game of Life with Python #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """A minimal implementation of Conway's Game of Life. source : http://www.exolete.com/code/life modified by par Jérémie Knoops, BA2 chimie UMONS, 2011-2012 cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Jeu_de_la_vie & http://en.wikipedia.org/wiki/Conway%27s_Game_of_Life Each cell's survival depends on the number of occupied nearest and next-nearest neighbours (calculated in Grid::step). A living cell dies of ov…

teaching:progappchim:polynomes-10

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:53:33+00:00

Polynômes : fonctionnalités supplémentaires Voici quelques fonctions utiles pour manipuler les polynômes : Dérivation Proposé et testé par RL, étudiant ba2 2012-2013. #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- def polyderiv(a): """ dérivation d'un polynôme """ b = a[:] #copie de la liste des coefficients du polynôme de départ n = len(b) -1 #ordre du polynôme for i in range (n+1): b[i] = b[i] * i #on redéfinit chaque coefficient i de la liste par ce…

teaching:progappchim:ppoo

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-01-28T16:31:18+00:00

Programmation Python Orientée Objet FIXME : en construction Concepts utilisés * Un objet : c'est... n'importe quoi, qui peut être codé. En Python, tout est objet ! * Une classe est une description générique d'un type d'objet, incluant les données et les méthodes qui le caractérisent

teaching:progappchim:plotly_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-02T10:38:45+00:00

Les bases de Plotly Plotly ( est une société développant des outils analytiques et de visualisation. La librairie python Plotly permet de créer des graphes dans l'environnement de Jupyter. FIXME : à compléter Références * plot.ly, le site officiel

teaching:progappchim:presentation_principes

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-02-21T14:56:20+00:00

~~REVEAL transition=convex&controls=1&show_progress_bar=1&build_all_lists=1&open_in_new_window=1~~ Programmer en Python Généralités * Qu'est-ce qu'un langage de programmation ? * Compilation ou interprétation, ou... ? Rôle des langages de programmation

teaching:progappchim:mendeleev

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-11-20T11:08:54+00:00

Librairie Mendeleev La librairie Mendeleev est complète et évoluée * Package repository sur PyPI : * Page officielle, description et code source : * Documentation complète : * Tutoriels : * Notebook Jupyter (exemples) : *

teaching:progappchim:algos_entiers

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-01-10T09:04:54+00:00

Algorithmes sur entiers cf....... Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie. Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur) Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d'entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L'algorithme d'Euclide décompose ce re…

teaching:progappchim:bokeh_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-10-13T13:23:12+00:00

Les bases de Bokeh, une librairie pour des visualisations interactives dans un navigateur web * page d'entrée sur Bokeh * User guide * Galerie d'exemples * Bokeh dans les Jupyter notebooks * Bokeh tutorial in live Jupyter Notebooks * Reference guide * Réseaux sociaux : * Twitter * GitHub * Youtube Exemples scientifiques * Interactions sur la fonction sinus (amplitude, décalage vertical, fréquence, déphasage) +

teaching:progappchim:numpy_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-03-07T13:05:54+00:00

Les bases de NumPy NumPy est une extension du langage de programmation Python, destinée à manipuler des matrices ou tableaux multidimensionnels ainsi que des fonctions mathématiques opérant sur ces tableaux. Chaque élément d'un tableau numpy occupe un nombre fixe d'octets, associé à un type particulier de donnée (data-type, ou dtype). Les types les plus courants incluent les entiers, bytes, entiers courts, booléens, nombres en virgule flottante, nombres complexes,

teaching:progappchim:start

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-03-13T10:14:25+00:00

Programmation appliquée à la chimie Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !! Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T08:52:04+00:00

Suite de Fibonacci : écriture de fonctions Voici la structure que doit avoir un programme pour lequel le calcul de l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci est encapsulé dans une fonction : #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci """ def fibonacci_item(n): """ Renvoie l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci """ ... if __name__ == '__main__'…

teaching:progappchim:solubilite_ph_t

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-04T15:24:32+00:00

Solubilité en fonction du pH et de la température Interface en ligne de commande et graphiques matplotlib Nécessite [ce fichier de données] (à décompresser). #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“

teaching:progappchim:altair_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-06-01T17:55:38+00:00

les bases de Altair, une librairie graphique interactive * Altair: Declarative Visualization in Python — Altair 4.1.0 documentation * altair · PyPI * (Tutorial) Altair in Python: Data Visualizations - DataCamp * Python Interactive Data Visualization with Altair - Towards Data Science * Stackoverflow * python - Altair not rendering chart in jupyter notebook - Stack Overflow * python - Not able to display altair charts in jupyter notebook - Stack Overflow

teaching:progappchim:jupyter

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-06-10T08:56:04+00:00

Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab * Jupyter a succédé à IPython Notebook * Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C'est la manière la plus adéquate d'utiliser Jupyter. * Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme

teaching:progappchim:openbabel_jmol

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-14T17:28:30+00:00

OpenBabel et Jmol OpenBabel OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats. * Site officiel : * Interfaçage en Python : Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,

teaching:progappchim:polynomes-7

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-02-25T11:06:31+00:00

Polynômes : comment les multiplier par un scalaire et les additionner #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes + fonction de multiplication d'un polynôme pas un scalaire + fonction d'addition de deux polynômes """ from math import * def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a) - 1 # n = ordre du polynôme p =0. for…

teaching:progappchim:polynomes-11

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:58:51+00:00

Graphe d'une famille de polynômes orthogonaux Voici un programme permettant de visualiser les premiers polynômes orthogonaux de Tchebyshev : #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ graphes de Polynomes de Chebyschev """ from math import * from pylab import * def polyeval(x,a): """ application de l'algorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynome p = 0. for i in range(n,-1,-1): …

teaching:progappchim:representation_molecules_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-03-09T14:42:50+00:00

Représentation de molécules Page à actualiser... Certaines fonctions de ce programme nécessite des fichiers de données : [base.csv] et [bdd.csv] #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- # travail de RL, ba2 chimie 2012-2013

teaching:progappchim:tkinter_gui_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-01-19T15:46:31+00:00

Les bases d'un interface graphique avec Tkinter Quelques références de base pour utiliser Tkinter * Documentation officielle : * Les interfaces graphiques TK * tkinter — interface Python à Tcl/Tk, reprenant quelques références recommandées * Python 3 avec Tk intègre également les extensions

teaching:progappchim:tris

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-12-09T14:25:44+00:00

Algorithmes de tri Un algorithme de tri est, en informatique ou en mathématiques, un algorithme qui permet d'organiser une collection d'objets selon un ordre déterminé (Référence wikipedia). Les tris sont intéressants du point de vue de l'apprentissage de l'algorithmique.

teaching:progappchim:csv

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-11T10:19:00+00:00

Lire et écrire des fichiers de données csv pandas Les fichiers csv sont des fichiers de données séparées par des virgules (ou point-virgules), pour “comma separated values”. Comme ceci : 1;0.1;3 2;0.3;5 3;0.5;7 4;0.6;11 5;0.9;21 6;1.5;39 Ils peuvent être facilement importés ou exportés de tableurs ou logiciels de graphiques scientifiques.

teaching:progappchim:elements_molecules

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-02T12:31:46+00:00

Éléments et molécules Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.

teaching:progappchim:pavage_penrose_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-28T14:08:53+00:00

Pavage de Penrose #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # réference : # version un peu aménagée du travail de EC et LP, ba2 chimie 2012-2013 import math import cmath import cairo # definir le nombre d'or goldenRatio = (1 + math.sqrt(5)) / 2

teaching:progappchim:solvents_data_class

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2012-11-30T13:39:08+00:00

Utilisation d'une "classe" pour des données de solvants chimiques On peut utiliser la structure de classe pour créer une “table” de données sur des solvants. Il est alors possible d'effectuer des traitements de tris, sélection, impression...

teaching:progappchim:ensemble_mandelbrot_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-03-02T17:01:15+00:00

Ensemble de Mandelbrot Dessin d'une fractale : l'ensemble de Mandelbrot #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # version un peu aménagée du travail de BF, ba2 chimie 2012-2013 # ref : from Tkinter import * from random import randrange

teaching:progappchim:lennard-jones

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-03-05T12:14:55+00:00

Représentation du potentiel de Lennard-Jones L'utilisation de fonctions en python permet de nombreuses applications par la création de graphiques. En utilisant la “bibliothèque matplotlib/pylab”, vous pourrez donc aisément créer des graphes de fonction.$V_{LJ} = 4\varepsilon \left[ \left(\frac{\sigma}{r}\right)^{12} - \left(\frac{\sigma}{r}\right)^{6} \right] = \varepsilon \left[ \left(\frac{r_{m}}{r}\right)^{12} - 2\left(\frac{r_{m}}{r}\right)^{6} \right]$$r_{m} = 2^{1/6} \sigma$$U_{tot} = \fr…

teaching:progappchim:ph_acides_bases_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T11:16:13+00:00

Représentation de pH d'acides et de bases Pour les acides : #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # travail de QD et TB, ba2 chimie 2012-2013 import Tkinter as tk from numpy import * import matplotlib.pyplot as plt

teaching:progappchim:polynomes-8

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:43:18+00:00

Polynômes : graphes de fonctions polynomiales #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ from math import * from pylab import * # librairies de graphiques (matplotlib) def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynome p = 0. for i in range(n,-1,-1): p = p*x + a[i] return p def…

teaching:progappchim:polynomes-bonus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-01T14:36:46+00:00

Polynômes : bonus Décomposition d'un polynôme en somme de deux polynômes, pair et impair #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ décomposition d'un polynôme en deux polynômes, respectivement pair et impair, qui par sommation rendent le polynôme intial """ def polyadd(a,b): """ Addition de deux polynômes de coefficients a et b """ r = a[:] # on travaille sur une copie de a pour ne pas le modifier t = b[:] # idem pour b g = [] # polynôme som…

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-4

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:09:35+00:00

Suite de Fibonacci : encore un algorithme Voici le programme complété pour la technique récursive : #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci Application de la définition par récursivité. """ def fibonacci_item_recursive(n): """ Renvoie l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci """ if n == 0: return 0 elif n == 1: return 1 ret…

teaching:progappchim:tableau_periodique_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-04-19T21:00:29+00:00

Tableau périodique FIXME : importation de la librairie tkinter à unifier + codes à améliorer #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Programme sur le tableau périodique # MJ, Ba2 chimie 2010-2011 from tkinter import * from element_liste import * #sert à importer la liste présente dans l'autre fichier #création de la commande générale du boutton def elem(x): element=Tk() element.title("Proprietes") listbox=Listbox(element,height=10,width=40,fg="#070942") listbox.pack(…

teaching:progappchim:tableau_periodique_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-04-14T12:03:16+00:00

Tableau périodique Tableau avec éléments cliquables pour obtenir les information. Nécessite [ce fichier de données]. #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # version un peu aménagée du travail de TD et SD, ba2 chimie 2012-2013 def elem(x): # print type(x),x # pour montrer que x est une chaîne de caractères element=Tk() element.title("Propriété du"+ x ) elembox=Listbox(element,height=32,width=40,fg="#070942") elembox.pack() for item in table[int(x)]: …

teaching:progappchim:trucs_astuces

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-04-30T11:09:36+00:00

Trucs et astuces * Fusionner deux dictionnaires * 0 Python Best Practices, Tips, And Tricks - Improve your Python knowledge and skills Erik van Baaren, Medium, Jan 5, 2020 * Apply These 4 Techniques To Write Concise Python Code - Write Python code in a Pythonic way, Yong Cui, Medium, 09/03/2021 * Python refactoring tips for cleaner code, Pralabh Saxena, Medium, Jul 26 2021 * 10 Python Snippets I Use Every Day - A few Python snippets - from sorting to list comprehensions - that I use n…

teaching:progappchim:matplotlib_gallery:pka_pkb_plane

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-06-02T15:05:22+00:00

Couples acide-base dans le plan pKa/pKb * Conventions sur les acides forts et les bases fortes : cf. Les acides, les bases et les sels qui nous entourent - Acide fort, base forte #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Library references : * """ import matplotlib.pyplot as plt # directive d'importation standard de Matplotlib import numpy as np # directive d'importation standard de numpy def cm2inch(*tupl): # https://stackoverflow.com/questions/14708695/sp…

teaching:progappchim:dictionaries_adn_arn_protein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-04T16:14:25+00:00

Traduction ADN-ARN-protéine Avec l'interface Tk. Voir aussi le programme Traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés (protéine) : utilisation d'un dictionnaire (type Python) #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“ Traduction de codes ADN en ARN et protéine. Basé sur le travail de NR et CVDD, ba2 chimie 2013-2014

teaching:progappchim:dictionary_adn_protein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2012-11-30T13:28:07+00:00

Traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés #!/usr/bin/env python # -*- coding: iso-8859-1 -*- # python code to translante DNA sequences into proteins # traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés (protéine)

teaching:progappchim:grille_configurations_melange_binaire_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T11:05:09+00:00

Création d'une grille et de configurations d'un système binaire modélisé #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # travail de ML et MP, ba2 chimie 2012-2013 # Création d'une grille et de configurations d'un système binaire modélisé

teaching:progappchim:matrices

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2018-03-06T14:49:57+00:00

Manipulations de matrices Les matrices sont des tableaux de nombres à deux dimensions. On peut utiliser des listes de lignes, qui sont elles-mêmes des listes d'éléments de la ligne, pour représenter une matrice. On aura donc des listes de listes.

teaching:progappchim:osm_interrogation

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-01-15T13:38:34+00:00

Interrogation de la base de données géolocalisées OpenStreetMap API OSM en Python * Application Programming Interface, en Python Installation via pip : pip(3) install osmapi Exemple de code Recherche de débit de boissons (“pub”) via la base de données d'OpenStreetMap. #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*-

teaching:progappchim:ph-3d

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-16T09:27:32+00:00

Représentation 3D du pH Cas d'un acide en fonction d'un ajout de base et d'une dilution globale : cf. cet article #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Use of numpy polynomes to compute pH of weak acid and strong base 3D topographic surface generation in the same conditions as the following paper : 3-D Surface Visualization of pH Titration “Topos”: Equivalence Point Cliffs, Dilution Ramps, and Buffer Plateaus" Garon C. Smith, Md Mainul Hossain and Patrick MacCarthy J. Chem. Ed…

teaching:progappchim:attracteur_lorenz

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-08-11T11:26:20+00:00

L'attracteur de Lorenz L'attracteur de Lorenz est un système d'équations différentielles ordinaires au comportement particulier, chaotique. C'est un exemple classique de nombreux cours scientifiques, et plusieurs sites proposent des solutions. Avec du code appliquant le méthode de Runge-Kutta d'ordre 4

teaching:progappchim:collection_counter_exemple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-01-18T11:49:53+00:00

Exemple d'utilisation de Counter Module collections : * * #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Recherche du nombre d'occurences des noms d'auteurs d'un article On copie dans all_authors les noms des auteurs http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26799652 """ import collections all_authors = "Klionsky DJ, Abdelmohsen K, Abe A, Abedin MJ, Abeliovich H,..." authors = all_auth…

teaching:progappchim:conversion_temperature_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-02-11T08:16:38+00:00

Conversion de températures #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Conversion de témpératures # programme réalisé par AC&JD, ba2 chimie 2010-2011 from Tkinter import * def delwidgets():

teaching:progappchim:fit_modele_einstein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-04-01T15:47:31+00:00

Optimisation de la température caractéristique du diamant suivant le modèle d'Einstein Ce modèle prévoie la dépendance à la température de la capacité calorifique d’un solide cristallin. La détermination de la température caractéristique nécessite de

teaching:progappchim:fizz_buzz

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T14:35:03+00:00

Fizz buzz Fizz buzz est un jeu de comptage et de divisibilité conçu pour des enfants. Les joueurs comptent à tour de rôle en incrémentant, partant de 1, et remplaçant chaque nombre divisible par 3 par le mot “fizz”, et chaque mot divisible par 5 par le mot

teaching:progappchim:glossaire_chimie

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-04-29T12:13:50+00:00

Glossaire de chimie Cf. le glossaire de chimie #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Utilisation du glossaire https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:glossaire-chimie Le code dokuwiki source doit être sauvegardé dans un fichier glossaire-dokuwiki.txt Programme de base à modifier/compléter. """ from pathlib import Path home = str(Path.home()) # fichier d'entrée with open(home + "/tempo/glossaire-dokuwiki.txt", "r") as ifile: lines = ifile.readlines() ifile.close() …

teaching:progappchim:koch_snowflake

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-03-07T14:37:23+00:00

Flocon de Koch Courbe fractale créée suivant un principe de récursivité, en utilisant la librairie turtle #!/usr/bin/env python # -*- coding: iso-8859-1 -*- # exemple de courbe fractale (Koch) # cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Flocon_de_von_Koch # et http://en.wikipedia.org/wiki/Koch_snowflake # ce programme est basé sur un principe de récursivité # (une fonction qui s'appelle elle-même) from turtle import * # module turtle. Doc : http://docs.python.org/library/turtle.html from time impo…

teaching:progappchim:math_nombres

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-01-14T13:58:23+00:00

Mathématiques et nombres Quelques programmes et algorithmes reliés aux mathématiques et aux nombres. * Théorie des nombres * Nombre_remarquable * ... Calculs en précision arbitraire * 1/9² = 0.0123456790123456790123456790123456790123456790123457... * 1/99² = 0.0001020304050607080910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697990001020304050607080910111$…

teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-23T15:33:34+00:00

Graphe simple de sinus et cosinus On montre en détail comment réaliser une représentation graphique simple des fonctions sinus et cosinus. Au départ le graphique utilisera les réglages par défaut et la figure sera ensuite améliorée pas à pas en commentant les instructions matplotlib utilisées.

teaching:progappchim:polynomes-4

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:16:13+00:00

Polynômes : structure de répétition (boucle for) #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a) - 1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p varx = 0.5 varc…

teaching:progappchim:polynomes-5

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:18:12+00:00

Polynômes : boucle for, fonction mathématique #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ from math import * def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a)-1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p …

teaching:progappchim:polynomes-6

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T10:01:39+00:00

Polynômes : la méthode de Horner 432 Cela revient à effectuer les opérations successives suivantes : * prendre le coefficient de x4 * multiplier par x * ajouter le coefficient de x3 * multiplier par x * ajouter le coefficient de x2 *

teaching:progappchim:polynomes-9

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:45:14+00:00

Polynômes : graphe multiple fonctions polynomiales # -*- coding: utf-8 -*- """ graphe multiple de polynômes de Tchebyshev cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Polyn%C3%B4me_de_Tchebychev """ from pylab import * # librairie graphique (Matplotlib) def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynôme p = 0. for i in range(n,-1,-1): p = p*x + a[i] …

teaching:progappchim:rdkit

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-27T22:54:03+00:00

RDKit * * Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation * Depict a compound as an image | Chemistry Toolkit Rosetta Wiki | Fandom * Jupyter & RDKit * Getting Started with RDKit and Jupyter | Depth-First * * ChemSpider | Search and share chemistry site reprenant de nombreuses informations sur des molécules * ... Utilisation avec Anaconda “” Utili…

teaching:progappchim:scikit_learn

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2018-03-19T16:18:01+00:00

Scikit-learn * * FIXME : ajouter des exemples avec analyse de textes contenant des termes scientifiques, des noms de substances chimiques,... * Scikit-chem, simple cheminformatics for Python * MolMiner, for extracting compounds from scientific literature *

teaching:progappchim:slices

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-01-02T10:15:18+00:00

Slices sur les séquences L'utilisation des “slices” ou du “slicing” sur les listes, ou sur tout objet en séquence (tuple, chaîne de caractères, ...) permet de “découper” des sous-listes. Si la séquence s'appelle sequence_name, la syntaxe du slice est : sequence_name[start:stop:step] où start est l'indice du premier élément (par défaut 0), stop est l'indice du premier élément NON REPRIS (par défaut len(seq

teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-12-07T17:22:27+00:00

Surface d'énergie potentielle Historique Eyring et Polanyi ont publié en 1931 l'article On Simple Gas Reactions dans lequel ils décrivent les trajets des atomes dans la réaction + H --> H + (échange d'atomes). Ces travaux aboutiront au développement des notions de $E_{bond}= D_e [\exp(-2\beta(r-r_e))-2\exp(-\beta(r-r_e))]$$E_{ant}= \frac{D_e}{2} [\exp(-2\beta(r-r_e))+2\exp(-\beta(r-r_e))]$$r_e$$D_e$$\beta$$E_{bond}= \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+S^2_{AB}} = \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+k}$$E_{a…

teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-02-25T10:04:25+00:00

Potentiel de Morse Potentiel de Morse et approximation harmonique, avec représentation des niveaux d'énergie des modèles quantiques correspondants. Code source : #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Représentation du potentiel de Morse pour H2 http://en.wikipedia.org/wiki/Morse_potential http://en.wikipedia.org/wiki/Quantum_harmonic_oscillator approximation harmonique D_e = 7.6E-19 J a = 19.3E-15 m r_e= 74.1E-12 m dérivée de seconde d2V/dr2 = 2 * D_e * a**2. """ import matplot…

teaching:progappchim:analyse_images

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-09T11:25:40+00:00

Analyse d'images Le traitement d'images permet de transformer des images. L'analyse d'images permet d'extraire des informations contenues dans une image. Il est aussi possible d'effectuer des tâches plus complexes de reconnaissance et d'analyse de scènes.

teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-01-15T13:48:26+00:00

Modélisation de la diffusion chimique dans un film Technique de différences finies, utilisation de matplotlib #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- from math import * # pour utiliser la librairie graphique matplotlib from pylab import *

teaching:progappchim:factorielle-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:28:44+00:00

Factorielle : une fonction en Python Voici une version avec la fonction factorielle() #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calcul de la factorielle d'un nombre Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Factorielle """ def factorielle(arg_n): """ structure de répétition pour appliquer la définition de la factorielle """ reponse = 1 # la réponse sera dans la variable reponse i = 1 # on va commencer par 1 while i <= arg_n: …

teaching:progappchim:multilateration

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-07-28T05:21:15+00:00

Multilateration Références * * * dépendance : * Trilateration * True-range multilateration * * *

teaching:progappchim:polynomes-2

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:13:40+00:00

Polynômes : évaluation #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynômes """ x = 3. # variable en laquelle on veut évaluer le polynôme a = [2.5, 6., 1.2, 3, 5] # la liste des coefficients, par ordre croissant n = len(a) - 1 # l'ordre du polynôme print(x,a,n) p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes print(p)

teaching:progappchim:polynomes-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:11:41+00:00

Polynômes : fonction pour évaluer #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a) - 1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p # premier exemple d'utilisation …

teaching:progappchim:polynomes-12

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-12-08T17:49:25+00:00

Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy Voici un programme permettant d'obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l'intérêt d'utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l'importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.

teaching:progappchim:print_format

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-04-09T05:22:18+00:00

Impressions avec la méthode .print() FIXME : * à compléter par les règles essentielles et quelques exemples * F-strings introduite depuis Python 3.6 Références * * * * F-strings * * Python’s F-Strings - Complete implementation guide with code… Naina Chatu…

teaching:progappchim:scipy_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-03-22T12:07:33+00:00

Les bases de SciPy La librairie SciPy ajoute à NumPy des fonctionnalités mathématiques. Directive d'importation * Méthode standard : import scipy as sp * Importation par sous-modules (cf le site de Scipy) : from scipy import optimize from scipy import interpolate from scipy import integrate ...

teaching:progappchim:t-test

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-07-03T16:17:41+00:00

Test de Student Le test de Student (t-test) teste statistiquement l’hypothèse d’égalité de l'espérance de deux variables aléatoires suivant une loi normale et de variance inconnue. Références * (des exemples simples) * Documentation Python sur stats de scipy * 1-sample t-test * Unpaired t-test * Paired t-test

teaching:progappchim:urllib

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-21T15:46:48+00:00

Lecture du code source d'une page web via la librairie urllib #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ exemple de programme pour obtenir le code d'une page avec la librairie urllib source : https://realpython.com/python-web-scraping-practical-introduction/ """ from urllib.request import urlopen site_url = 'https://dvillers.umons.ac.be/wiki/page_simple' page = urlopen(site_url) print(page) # page est un objet urllib html_bytes = page.read() html = html_bytes.decode("utf-8") # html …

teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-05-12T10:04:44+00:00

Spectre IR du CO Différentes techniques de spectroscopie utilisent des représentations standardisées des spectres. En spectroscopie Infrarouge, l'absorbance est traditionnellement représentée en fonction des nombres d'ondes décroissants exprimés en $cm^{-1}$. Pour rappel, en spectroscopie, le $\tilde{\nu}$$\tilde{\nu} = 1/\lambda = \nu/c$$\Delta J = \pm 1$$cm^{-1}$

teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2018-02-20T10:00:26+00:00

Rotateur biatomique Cf. cette page. Code source, en Python 3 : #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Somme d'état (ensemble canonique) de rotation (rotateur biatomique) Les impressions sont à récrire avec l'instruction format() de python 3 """ from math import exp # on a juste besoin de l'exponentielle import matplotlib.pyplot as plt # directive d'importation standard de Matplotlib T = 100. # (température réduite = T / Theta) Zrot = 0. # somme d'état Jmax = 30 # valeur …

Didier Villers, UMONS - wiki

teaching:progappchim:notions_fondamentales