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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <title>teaching:progappchim:tkinter_gui_simple</title>
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        <description>Les bases d&#039;un interface graphique avec Tkinter

Quelques références de base pour utiliser Tkinter

	*  Documentation officielle :
		*  Les interfaces graphiques TK
			*  tkinter — interface Python à Tcl/Tk, reprenant quelques références recommandées
			*  Python 3 avec Tk intègre également les extensions</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_simple?rev=1689054396&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_simple</title>
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        <description>Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D

Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:presentation_principes</title>
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        <description>~~REVEAL transition=convex&amp;controls=1&amp;show_progress_bar=1&amp;build_all_lists=1&amp;open_in_new_window=1~~

Programmer en Python

Généralités

	*  Qu&#039;est-ce qu&#039;un langage de programmation ?
	*  Compilation ou interprétation, ou... ?

Rôle des langages de programmation</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:representation_molecules_2013?rev=1583761370&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:representation_molecules_2013</title>
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        <description>Représentation de molécules

Page à actualiser...

Certaines fonctions de ce programme nécessite des fichiers de données : [base.csv] et [bdd.csv]
&lt;sxh python; title : representation_molecules.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-
# travail de RL, ba2 chimie 2012-2013</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:algos_entiers</title>
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        <description>Algorithmes sur entiers
cf.......
Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie.

Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur)

Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d&#039;entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L&#039;algorithme d&#039;Euclide décompose ce re…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:analyse_images?rev=1615285540&amp;do=diff">
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        <description>Analyse d&#039;images

Le traitement d&#039;images permet de transformer des images. L&#039;analyse d&#039;images permet d&#039;extraire des informations contenues dans une image. Il est aussi possible d&#039;effectuer des tâches plus complexes de reconnaissance et d&#039;analyse de scènes.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:fit_modele_einstein</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff</link>
        <description>Optimisation de la température caractéristique du diamant suivant le modèle d&#039;Einstein

Ce modèle prévoie la dépendance à la température de la capacité calorifique d’un solide cristallin.

La détermination de la température caractéristique nécessite de</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:numpy_simple?rev=1678190754&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:numpy_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:numpy_simple?rev=1678190754&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de NumPy

NumPy est une extension du langage de programmation Python, destinée à manipuler des matrices ou tableaux multidimensionnels ainsi que des fonctions mathématiques opérant sur ces tableaux.

Chaque élément d&#039;un tableau numpy occupe un nombre fixe d&#039;octets, associé à un type particulier de donnée (data-type, ou dtype). Les types les plus courants incluent les entiers, bytes, entiers courts, booléens, nombres en virgule flottante, nombres complexes,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pavage_penrose_2013?rev=1385644133&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:pavage_penrose_2013</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pavage_penrose_2013?rev=1385644133&amp;do=diff</link>
        <description>Pavage de Penrose

&lt;sxh python; title : pavage_penrose.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# réference :  &lt;http://preshing.com/20110831/penrose-tiling-explained&gt;
# version un peu aménagée du travail de EC et LP, ba2 chimie 2012-2013

import math
import cmath
import cairo

 # definir le nombre d&#039;or 
goldenRatio = (1 + math.sqrt(5)) / 2</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:pka_pkb_plane?rev=1591103122&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:pka_pkb_plane</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:pka_pkb_plane?rev=1591103122&amp;do=diff</link>
        <description>Couples acide-base dans le plan pKa/pKb

	*  Conventions sur les acides forts et les bases fortes : cf. Les acides, les bases et les sels qui nous entourent - Acide fort, base forte


#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-

&quot;&quot;&quot;
Library references :
  * 

&quot;&quot;&quot;
import matplotlib.pyplot as plt  # directive d&#039;importation standard de Matplotlib
import numpy as np               # directive d&#039;importation standard de numpy

def cm2inch(*tupl):
    # https://stackoverflow.com/questions/14708695/sp…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface?rev=1607358147&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
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        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface?rev=1607358147&amp;do=diff</link>
        <description>Surface d&#039;énergie potentielle

Historique

Eyring et Polanyi ont publié en 1931 l&#039;article On Simple Gas Reactions dans lequel ils décrivent les trajets des atomes dans la réaction  + H --&gt; H +  (échange d&#039;atomes). Ces travaux aboutiront au développement des notions de $E_{bond}= D_e [\exp(-2\beta(r-r_e))-2\exp(-\beta(r-r_e))]$$E_{ant}= \frac{D_e}{2} [\exp(-2\beta(r-r_e))+2\exp(-\beta(r-r_e))]$$r_e$$D_e$$\beta$$E_{bond}= \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+S^2_{AB}} = \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+k}$$E_{a…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d?rev=1421326106&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d?rev=1421326106&amp;do=diff</link>
        <description>Modélisation de la diffusion chimique dans un film

Technique de différences finies, utilisation de matplotlib

&lt;sxh  python; title : Diffusion-chimique-finitediff-01.py&gt;
#!/usr/bin/env python 
# -*- coding: utf-8 -*-
from math import *
# pour utiliser la librairie graphique matplotlib
from pylab import *</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:mendeleev?rev=1668938934&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:mendeleev</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:mendeleev?rev=1668938934&amp;do=diff</link>
        <description>Librairie Mendeleev

La librairie Mendeleev est complète et évoluée

	*  Package repository sur PyPI : &lt;https://pypi.org/project/mendeleev/&gt;
	*  Page officielle, description et code source : &lt;https://github.com/lmmentel/mendeleev&gt;
	*  Documentation complète : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/&gt;
		*  Tutoriels : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/tutorials.html&gt;

	*  Notebook Jupyter (exemples) : 
		*  &lt;https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/sou…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:ph-3d</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation 3D du pH

Cas d&#039;un acide en fonction d&#039;un ajout de base et d&#039;une dilution globale : cf. cet article


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Use of numpy polynomes to compute pH of weak acid and strong base

3D topographic surface generation in the same conditions as
the following paper :
3-D Surface Visualization of pH Titration “Topos”:
Equivalence Point Cliffs, Dilution Ramps, and Buffer Plateaus&quot;  
Garon C. Smith, Md Mainul Hossain and Patrick MacCarthy
J. Chem. Ed…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus?rev=1614090814&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus?rev=1614090814&amp;do=diff</link>
        <description>Graphe simple de sinus et cosinus

On montre en détail comment réaliser une représentation graphique simple des fonctions sinus et cosinus. Au départ le graphique utilisera les réglages par défaut et la figure sera ensuite améliorée pas à pas en commentant les instructions matplotlib utilisées.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-11?rev=1487933931&amp;do=diff">
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        <dc:date>2017-02-24T11:58:51+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:polynomes-11</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-11?rev=1487933931&amp;do=diff</link>
        <description>Graphe d&#039;une famille de polynômes orthogonaux

Voici un programme permettant de visualiser les premiers polynômes orthogonaux de Tchebyshev :


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
graphes de Polynomes de Chebyschev
&quot;&quot;&quot;

from math import *
from pylab import *

def polyeval(x,a):
    &quot;&quot;&quot;
    application de l&#039;algorithme de Horner
    cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner
    &quot;&quot;&quot;
    n = len(a)-1 # n = ordre du polynome
    p = 0.
    for i in range(n,-1,-1):
…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-12?rev=1670518165&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-12-08T17:49:25+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:polynomes-12</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-12?rev=1670518165&amp;do=diff</link>
        <description>Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy

Voici un programme permettant d&#039;obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l&#039;intérêt d&#039;utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l&#039;importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-03-08T09:43:21+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pylab_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff</link>
        <description>Pylab

Pylab permet de combiner simplement Matplotlib, NumPy et SciPy, en utilisant une directive d&#039;importation supprimant l&#039;usage de tous les namespaces des librairies sous-jacentes :

from pylab import *

Exemple

Version “Pylab” du code utilisé pour la</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:rdkit?rev=1685220843&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-05-27T22:54:03+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:rdkit</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:rdkit?rev=1685220843&amp;do=diff</link>
        <description>RDKit

	*  &lt;http://www.rdkit.org/&gt;
	*  Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation
	*  Depict a compound as an image | Chemistry Toolkit Rosetta Wiki | Fandom
	*  Jupyter &amp; RDKit
		*  Getting Started with RDKit and Jupyter | Depth-First
		*  &lt;http://davies-lee.com/index.php/2018/10/06/rdkit-in-jupyter-notebooks/&gt;

	*  ChemSpider | Search and share chemistry site reprenant de nombreuses informations sur des molécules
	*  ...

Utilisation avec Anaconda

“”



Utili…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2?rev=1487922675&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2017-02-24T08:51:15+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2?rev=1487922675&amp;do=diff</link>
        <description>Suite de Fibonacci : un premier programme

Voici un embryon non fonctionnel de programme. Il y manque alors des éléments (à la place des “???”)


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci.
Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci
&quot;&quot;&quot;
# élément d&#039;indice 0
i = 0
a = 0
print(i,a)
# élément d&#039;indice 1
i = 1
b = 1
print(i,b)

# structure de répétition pour appliquer la règle de récurrence
max = 100 # indice du dernier …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-05-12T10:04:44+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff</link>
        <description>Spectre IR du CO

Différentes techniques de spectroscopie utilisent des représentations standardisées des spectres. En spectroscopie Infrarouge, l&#039;absorbance est traditionnellement représentée en fonction des nombres d&#039;ondes décroissants exprimés en $cm^{-1}$. Pour rappel, en spectroscopie, le $\tilde{\nu}$$\tilde{\nu} = 1/\lambda = \nu/c$$\Delta J = \pm 1$$cm^{-1}$</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse?rev=1582621465&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2020-02-25T10:04:25+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse?rev=1582621465&amp;do=diff</link>
        <description>Potentiel de Morse

Potentiel de Morse et approximation harmonique, avec représentation des niveaux d&#039;énergie des modèles quantiques correspondants.

Code source : 


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Représentation du potentiel de Morse pour H2
http://en.wikipedia.org/wiki/Morse_potential
http://en.wikipedia.org/wiki/Quantum_harmonic_oscillator approximation harmonique
D_e = 7.6E-19 J
a = 19.3E-15 m
r_e= 74.1E-12 m
dérivée de seconde d2V/dr2 = 2 * D_e * a**2.
&quot;&quot;&quot;
import matplot…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique?rev=1519117226&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2018-02-20T10:00:26+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique?rev=1519117226&amp;do=diff</link>
        <description>Rotateur biatomique

Cf. cette page.

Code source, en Python 3 : 


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Somme d&#039;état (ensemble canonique) de rotation (rotateur biatomique)

Les impressions sont à récrire avec l&#039;instruction format() de python 3
&quot;&quot;&quot;

from math import exp    # on a juste besoin de l&#039;exponentielle
import matplotlib.pyplot as plt  # directive d&#039;importation standard de Matplotlib

T = 100. # (température réduite = T / Theta)
Zrot = 0.  # somme d&#039;état
Jmax = 30  # valeur …</description>
    </item>
</rdf:RDF>
