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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <dc:date>2023-03-07T13:05:54+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:numpy_simple</title>
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        <description>Les bases de NumPy

NumPy est une extension du langage de programmation Python, destinée à manipuler des matrices ou tableaux multidimensionnels ainsi que des fonctions mathématiques opérant sur ces tableaux.

Chaque élément d&#039;un tableau numpy occupe un nombre fixe d&#039;octets, associé à un type particulier de donnée (data-type, ou dtype). Les types les plus courants incluent les entiers, bytes, entiers courts, booléens, nombres en virgule flottante, nombres complexes,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-12?rev=1670518165&amp;do=diff">
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        <dc:date>2022-12-08T17:49:25+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:polynomes-12</title>
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        <description>Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy

Voici un programme permettant d&#039;obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l&#039;intérêt d&#039;utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l&#039;importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:scipy_simple?rev=1553252853&amp;do=diff">
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        <dc:date>2019-03-22T12:07:33+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:scipy_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:scipy_simple?rev=1553252853&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de SciPy

La librairie SciPy ajoute à NumPy des fonctionnalités mathématiques.

Directive d&#039;importation

	*  Méthode standard : 
import scipy as sp

	*  Importation par sous-modules (cf le site de Scipy) : 
from scipy import optimize
from scipy import interpolate
from scipy import integrate
...</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:t-test?rev=1404397061&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:t-test</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:t-test?rev=1404397061&amp;do=diff</link>
        <description>Test de Student

Le test de Student (t-test) teste statistiquement l’hypothèse d’égalité de l&#039;espérance de deux variables aléatoires suivant une loi normale et de variance inconnue.

Références

	*  &lt;http://iaingallagher.tumblr.com/post/50980987285/t-tests-in-python&gt; (des exemples simples)
	*  Documentation Python sur stats de scipy
		*  1-sample t-test
		*  Unpaired t-test
		*  Paired t-test</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:elements_molecules?rev=1614684706&amp;do=diff">
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        <dc:date>2021-03-02T12:31:46+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:elements_molecules</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:elements_molecules?rev=1614684706&amp;do=diff</link>
        <description>Éléments et molécules

Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:jupyter</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff</link>
        <description>Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab

	*  Jupyter a succédé à IPython Notebook
	*  Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C&#039;est la manière la plus adéquate d&#039;utiliser Jupyter.
	*  Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:koch_snowflake?rev=1488893843&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:koch_snowflake</title>
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        <description>Flocon de Koch

Courbe fractale créée suivant un principe de récursivité, en utilisant la librairie turtle


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: iso-8859-1 -*-

# exemple de  courbe fractale (Koch)
# cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Flocon_de_von_Koch
# et http://en.wikipedia.org/wiki/Koch_snowflake 
# ce programme est basé sur un principe de récursivité
# (une fonction qui s&#039;appelle elle-même)

from turtle import * # module turtle. Doc : http://docs.python.org/library/turtle.html
from time impo…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:math_nombres?rev=1579006703&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:math_nombres</title>
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        <description>Mathématiques et nombres

Quelques programmes et algorithmes reliés aux mathématiques et aux nombres.

	*  Théorie des nombres
	*  Nombre_remarquable
	*  ...

Calculs en précision arbitraire


	*  1/9² = 0.0123456790123456790123456790123456790123456790123457...
	*  1/99² = 0.0001020304050607080910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697990001020304050607080910111$…</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:notions_fondamentales</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_fondamentales?rev=1683095960&amp;do=diff</link>
        <description>Notions fondamentales

Aide mémoire synthétique sur le langage Python.

Règles de base

Ces règles peuvent être testées via le mode interactif de Python (en utilisant la fenêtre “Shell” ou console de l&#039;éditeur Idle ou Idle3 par exemple).</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:ph-3d</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation 3D du pH

Cas d&#039;un acide en fonction d&#039;un ajout de base et d&#039;une dilution globale : cf. cet article


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Use of numpy polynomes to compute pH of weak acid and strong base

3D topographic surface generation in the same conditions as
the following paper :
3-D Surface Visualization of pH Titration “Topos”:
Equivalence Point Cliffs, Dilution Ramps, and Buffer Plateaus&quot;  
Garon C. Smith, Md Mainul Hossain and Patrick MacCarthy
J. Chem. Ed…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_graphes?rev=1601968072&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:algos_graphes</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_graphes?rev=1601968072&amp;do=diff</link>
        <description>Algorithmes de graphes

Références diverses

	*  &lt;http://www.proteomesci.com/content/9/S1/S17&gt;
	*  &lt;http://people.unipmn.it/fragnelli/dispense/Chimica/Balaban.pdf&gt;
	*  &lt;https://www.python.org/doc/essays/graphs/&gt;
	*  &lt;https://medium.freecodecamp.com/a-gentle-introduction-to-data-structures-how-graphs-work-a223d9ef8837#.ud1ebjeia&gt;
	*  &lt;https://towardsdatascience.com/10-graph-algorithms-visually-explained-e57faa1336f3&gt;
	*  &lt;https://docs.python.org/3.9/library/graphlib.html&gt; (depuis Python 3.9)</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:entropie_melange?rev=1615285473&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:entropie_melange</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:entropie_melange?rev=1615285473&amp;do=diff</link>
        <description>Entropie de mélange pour un gaz ou liquide idéal


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
représentation graphique de l&#039;entropie de mélange d&#039;un système idéal
&quot;&quot;&quot;

import numpy as np  # voir http://docs.scipy.org/doc/
import matplotlib.pyplot as plt

def s(t):
    return t*np.log(t) + (1-t) * np.log(1-t)

x1 = np.arange(0.0, 1., 0.001)

plt.plot(x1, s(x1), &#039;b-&#039;)
#plt.plot(x1, x1*np.log(x1) + (1-x1) * np.log(1-x1), &#039;b-&#039;)   #autre façon, n&#039;utilisant pas la fonction

plt.show()

# des m…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:fit_modele_einstein</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff</link>
        <description>Optimisation de la température caractéristique du diamant suivant le modèle d&#039;Einstein

Ce modèle prévoie la dépendance à la température de la capacité calorifique d’un solide cristallin.

La détermination de la température caractéristique nécessite de</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:maxwell-boltzmann?rev=1391051992&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
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        <title>teaching:progappchim:maxwell-boltzmann</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:maxwell-boltzmann?rev=1391051992&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation de la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann

Pour la théorie, cf. le cours de physico-chimie ou la page Wikipédia sur la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann

Sans NumPy

&lt;sxh python; title : Maxwell-Boltzmann_01.py&gt;
#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“
NumPy/Matplotib : representation de la distribution de vitesses de Maxwell-Boltzmann
version SANS utilisation de NumPy
cf cours et</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff">
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        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff</link>
        <description>OpenBabel et Jmol

OpenBabel

OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.

	*  Site officiel : &lt;http://openbabel.org/wiki/Main_Page&gt;
	*  Interfaçage en Python : &lt;http://openbabel.org/wiki/Python&gt;

Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-11?rev=1487933931&amp;do=diff">
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        <dc:date>2017-02-24T11:58:51+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:polynomes-11</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-11?rev=1487933931&amp;do=diff</link>
        <description>Graphe d&#039;une famille de polynômes orthogonaux

Voici un programme permettant de visualiser les premiers polynômes orthogonaux de Tchebyshev :


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
graphes de Polynomes de Chebyschev
&quot;&quot;&quot;

from math import *
from pylab import *

def polyeval(x,a):
    &quot;&quot;&quot;
    application de l&#039;algorithme de Horner
    cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner
    &quot;&quot;&quot;
    n = len(a)-1 # n = ordre du polynome
    p = 0.
    for i in range(n,-1,-1):
…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-02-21T14:56:20+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:presentation_principes</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff</link>
        <description>~~REVEAL transition=convex&amp;controls=1&amp;show_progress_bar=1&amp;build_all_lists=1&amp;open_in_new_window=1~~

Programmer en Python

Généralités

	*  Qu&#039;est-ce qu&#039;un langage de programmation ?
	*  Compilation ou interprétation, ou... ?

Rôle des langages de programmation</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-03-08T09:43:21+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pylab_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff</link>
        <description>Pylab

Pylab permet de combiner simplement Matplotlib, NumPy et SciPy, en utilisant une directive d&#039;importation supprimant l&#039;usage de tous les namespaces des librairies sous-jacentes :

from pylab import *

Exemple

Version “Pylab” du code utilisé pour la</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-05-12T10:04:44+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff</link>
        <description>Spectre IR du CO

Différentes techniques de spectroscopie utilisent des représentations standardisées des spectres. En spectroscopie Infrarouge, l&#039;absorbance est traditionnellement représentée en fonction des nombres d&#039;ondes décroissants exprimés en $cm^{-1}$. Pour rappel, en spectroscopie, le $\tilde{\nu}$$\tilde{\nu} = 1/\lambda = \nu/c$$\Delta J = \pm 1$$cm^{-1}$</description>
    </item>
</rdf:RDF>
