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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <title>Didier Villers, UMONS - wiki</title>
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:start</title>
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        <description>Programmation appliquée à la chimie
&lt;https://lukasz.langa.pl/f15a8851-af26-4e94-a4b1-c146c57c9d20/&gt;
Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !!

Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:parsing_chemical_formula?rev=1488291120&amp;do=diff">
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        <dc:date>2017-02-28T15:12:00+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:parsing_chemical_formula</title>
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        <description>Décomposition de formules chimiques

Analyse de chaînes de caractères formées par la concaténation de symboles d&#039;éléments chimiques.

Problème de base

	*  Décomposer une chaîne de caractères formée par des symboles chimiques répétés : CaClCNOSbInAsFICl</description>
    </item>
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        <dc:date>2015-01-15T13:48:26+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d</title>
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        <description>Modélisation de la diffusion chimique dans un film

Technique de différences finies, utilisation de matplotlib

&lt;sxh  python; title : Diffusion-chimique-finitediff-01.py&gt;
#!/usr/bin/env python 
# -*- coding: utf-8 -*-
from math import *
# pour utiliser la librairie graphique matplotlib
from pylab import *</description>
    </item>
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        <dc:date>2021-03-02T12:31:46+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:elements_molecules</title>
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        <description>Éléments et molécules

Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-01-10T09:04:54+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:algos_entiers</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff</link>
        <description>Algorithmes sur entiers
cf.......
Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie.

Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur)

Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d&#039;entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L&#039;algorithme d&#039;Euclide décompose ce re…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_divers?rev=1670574996&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:algos_divers</title>
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        <description>Algorithmes divers

Problèmes résolus :

	*  Fizz buzz, jeu de comptage et de divisibilité conçu pour des enfants
	*  ...

Problèmes non résolus

	*  Décomposition de formules chimiques (analyse de chaînes de caractères)
	*  ...

Classiques

	*  Algorithme de Dijkstra (permet de déterminer le plus court chemin pour se rendre d&#039;un point à une autre en fonction du réseau routier)</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:jupyter</title>
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        <description>Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab

	*  Jupyter a succédé à IPython Notebook
	*  Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C&#039;est la manière la plus adéquate d&#039;utiliser Jupyter.
	*  Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:mendeleev</title>
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        <description>Librairie Mendeleev

La librairie Mendeleev est complète et évoluée

	*  Package repository sur PyPI : &lt;https://pypi.org/project/mendeleev/&gt;
	*  Page officielle, description et code source : &lt;https://github.com/lmmentel/mendeleev&gt;
	*  Documentation complète : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/&gt;
		*  Tutoriels : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/tutorials.html&gt;

	*  Notebook Jupyter (exemples) : 
		*  &lt;https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/sou…</description>
    </item>
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        <description>OpenBabel et Jmol

OpenBabel

OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.

	*  Site officiel : &lt;http://openbabel.org/wiki/Main_Page&gt;
	*  Interfaçage en Python : &lt;http://openbabel.org/wiki/Python&gt;

Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,</description>
    </item>
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        <title>teaching:progappchim:open_chemical_databases</title>
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        <description>Bases de données libres en chimie

Références

Databases, databank

	*  Chemical databases +...
	*  &lt;http://www.mtdcadd.com/&gt;
	*  &lt;http://www.drugbank.ca/&gt;
	*  &lt;http://www.genome.jp/kegg/&gt;
	*  &lt;http://zinc.docking.org/&gt;
	*  &lt;http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/&gt;

Données de wikipedia

	*  Chembox template
		*  &lt;http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Commodity_chemicals&gt;
		*  &lt;http://fr.wikipedia.org/wiki/Cat%C3%A9gorie:Produit_chimique&gt;
		*  &lt;http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Chemical_substanc…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux?rev=1457103767&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux</title>
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        <description>Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux

&lt;sxh  python; title : pressions_partielles_systemes_non_ideaux.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“
Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux
Basé sur le travail de ML et VM, ba2 chimie 2013-2014</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:scikit_learn?rev=1521472681&amp;do=diff">
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        <description>Scikit-learn

	*  &lt;http://scikit-learn.org&gt;
	*  &lt;http://www.innoarchitech.com/machine-learning-an-in-depth-non-technical-guide/&gt;

FIXME : ajouter des exemples avec analyse de textes contenant des termes scientifiques, des noms de substances chimiques,...

	*  Scikit-chem, simple cheminformatics for Python
	*  MolMiner, for extracting compounds from scientific literature
	*</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:solvents_data_class?rev=1354279148&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:solvents_data_class</title>
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        <description>Utilisation d&#039;une &quot;classe&quot; pour des données de solvants chimiques

On peut utiliser la structure de classe pour créer une “table” de données sur des solvants. Il est alors possible d&#039;effectuer des traitements de tris, sélection, impression...</description>
    </item>
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