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        <title>teaching:progappchim:math_nombres</title>
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        <description>Mathématiques et nombres

Quelques programmes et algorithmes reliés aux mathématiques et aux nombres.

	*  Théorie des nombres
	*  Nombre_remarquable
	*  ...

Calculs en précision arbitraire


	*  1/9² = 0.0123456790123456790123456790123456790123456790123457...
	*  1/99² = 0.0001020304050607080910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697990001020304050607080910111$…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_fondamentales?rev=1683095960&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:notions_fondamentales</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_fondamentales?rev=1683095960&amp;do=diff</link>
        <description>Notions fondamentales

Aide mémoire synthétique sur le langage Python.

Règles de base

Ces règles peuvent être testées via le mode interactif de Python (en utilisant la fenêtre “Shell” ou console de l&#039;éditeur Idle ou Idle3 par exemple).</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_simple?rev=1689054396&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-07-11T07:46:36+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_simple?rev=1689054396&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D

Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:start?rev=1678698865&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:start</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:start?rev=1678698865&amp;do=diff</link>
        <description>Programmation appliquée à la chimie
&lt;https://lukasz.langa.pl/f15a8851-af26-4e94-a4b1-c146c57c9d20/&gt;
Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !!

Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:epidemie_coronavirus?rev=1594605869&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:epidemie_coronavirus</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:epidemie_coronavirus?rev=1594605869&amp;do=diff</link>
        <description>Épidémie du coronavirus COVID-19

Références :

	*  Coronavirus disease 2019
	*  Maladie à coronavirus 2019
	*  Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE
	*  Coronavirus (COVID-19) Mortality Rate
	*  data : &lt;https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/tree/master/csse_covid_19_data&gt;

Programmes de représentations

FIXME

Quelques simulations SEIR effectuées par des scientifiques :

	*  Marius Gilbert (ULB/FNRS, Spatial Epidemiology lab (SpELL), &lt;https://twitter.com/mariusgilbert/sta…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pandas?rev=1668503305&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:pandas</title>
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        <description>Pandas

Module pour l&#039;analyse de données, pouvant se substituer à l&#039;utilisation d&#039;un tableur. Une différence fondamentale de la librairie pandas avec NumPy, c&#039;est que les tableaux NumPy (NumPy arrays) ont le même type (dtype) pour le tableau entier, tandis que les tableaux pandas (pandas DataFrames) sont caractérisés par un type unique (dtype) par colonne.$X$$x$$P(x)$$X$$x$$x_1, x_2, x_3, ...$$X$$P(x_i)$$X$$x$$P(x)$$x$$x+dx$$P(x)$$x$$P(x) dx$$P(x) dx = P(x \le X &lt; x+dx)$$P(x_i) \ge 0$$x_i$$P(x) …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_avancees?rev=1683016596&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:notions_avancees</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:notions_avancees?rev=1683016596&amp;do=diff</link>
        <description>Notions avancées

En construction. Les liens sont juste donnés. Une introduction et un exemple devrait être proposé pour chaque rubrique, et le nombre de ces rubriques augmenté.

Itérateurs

Itertools, zip,...

	*  7 Levels of Using the Zip Function in Python
	*  itertools.cycle() est une méthode utile pour répéter ou parcourir sans fin les éléments d&#039;une liste ou d&#039;une table itérativitertools.accumulate()</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tableau_periodique_2011?rev=1618858829&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:tableau_periodique_2011</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tableau_periodique_2011?rev=1618858829&amp;do=diff</link>
        <description>Tableau périodique

FIXME : importation de la librairie tkinter à unifier + codes à améliorer


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# Programme sur le tableau périodique
# MJ, Ba2 chimie 2010-2011

from tkinter import *
from element_liste import * #sert à importer la liste présente dans l&#039;autre fichier

#création de la commande générale du boutton
def elem(x):
    element=Tk()
    element.title(&quot;Proprietes&quot;)
    listbox=Listbox(element,height=10,width=40,fg=&quot;#070942&quot;)
    listbox.pack(…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012?rev=1385724811&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012?rev=1385724811&amp;do=diff</link>
        <description>Calul matriciel

&lt;sxh python; title : calcul_matriciel.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-
#&lt;http://www.siteduzero.com/tutoriel-3-223267-apprenez-a-programmer-en-python.html&gt; (pdf)
#&lt;http://stackoverflow.com/questions/455612/python-limiting-floats-to-two-decimal-points&gt;
#pour operation matriciel verification mathématique : &lt;http://fr.wikipedia.org/wiki/Wikip%C3%A9dia:Accueil_principal&gt;
#&lt;http://www.pythonfrance.com/codes/OPERATION-MATRICIELLE_48359.aspx&gt;
#&lt;http://inforef.be/swi/pyt…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plotly_simple?rev=1683016725&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:plotly_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plotly_simple?rev=1683016725&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de Plotly

Plotly (&lt;https://Plot.ly&gt; est une société développant des outils analytiques et de visualisation. La librairie python Plotly permet de créer des graphes dans l&#039;environnement de Jupyter. FIXME : à compléter

Références

	*  plot.ly, le site officiel</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique?rev=1519117226&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2018-02-20T10:00:26+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:rotateur_biatomique?rev=1519117226&amp;do=diff</link>
        <description>Rotateur biatomique

Cf. cette page.

Code source, en Python 3 : 


#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Somme d&#039;état (ensemble canonique) de rotation (rotateur biatomique)

Les impressions sont à récrire avec l&#039;instruction format() de python 3
&quot;&quot;&quot;

from math import exp    # on a juste besoin de l&#039;exponentielle
import matplotlib.pyplot as plt  # directive d&#039;importation standard de Matplotlib

T = 100. # (température réduite = T / Theta)
Zrot = 0.  # somme d&#039;état
Jmax = 30  # valeur …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-04-01T15:47:31+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:fit_modele_einstein</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:fit_modele_einstein?rev=1427896051&amp;do=diff</link>
        <description>Optimisation de la température caractéristique du diamant suivant le modèle d&#039;Einstein

Ce modèle prévoie la dépendance à la température de la capacité calorifique d’un solide cristallin.

La détermination de la température caractéristique nécessite de</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:numpy_simple?rev=1678190754&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-03-07T13:05:54+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:numpy_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:numpy_simple?rev=1678190754&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases de NumPy

NumPy est une extension du langage de programmation Python, destinée à manipuler des matrices ou tableaux multidimensionnels ainsi que des fonctions mathématiques opérant sur ces tableaux.

Chaque élément d&#039;un tableau numpy occupe un nombre fixe d&#039;octets, associé à un type particulier de donnée (data-type, ou dtype). Les types les plus courants incluent les entiers, bytes, entiers courts, booléens, nombres en virgule flottante, nombres complexes,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ppoo?rev=1674919878&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-01-28T16:31:18+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:ppoo</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ppoo?rev=1674919878&amp;do=diff</link>
        <description>Programmation Python Orientée Objet

FIXME : en construction

Concepts utilisés

	*  Un objet : c&#039;est... n&#039;importe quoi, qui peut être codé. En Python, tout est objet !
	*  Une classe est une description générique d&#039;un type d&#039;objet, incluant les données et les méthodes qui le caractérisent</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:trucs_astuces?rev=1682845776&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-04-30T11:09:36+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:trucs_astuces</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:trucs_astuces?rev=1682845776&amp;do=diff</link>
        <description>Trucs et astuces

	*  Fusionner deux dictionnaires
	*  0 Python Best Practices, Tips, And Tricks - Improve your Python knowledge and skills Erik van Baaren, Medium, Jan 5, 2020
	*  Apply These 4 Techniques To Write Concise Python Code - Write Python code in a Pythonic way, Yong Cui, Medium, 09/03/2021
	*  Python refactoring tips for cleaner code, Pralabh Saxena, Medium, Jul 26 2021
	*  10 Python Snippets I Use Every Day - A few Python snippets - from sorting to list comprehensions - that I use n…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2021-02-16T09:27:32+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:ph-3d</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:ph-3d?rev=1613464052&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation 3D du pH

Cas d&#039;un acide en fonction d&#039;un ajout de base et d&#039;une dilution globale : cf. cet article


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Use of numpy polynomes to compute pH of weak acid and strong base

3D topographic surface generation in the same conditions as
the following paper :
3-D Surface Visualization of pH Titration “Topos”:
Equivalence Point Cliffs, Dilution Ramps, and Buffer Plateaus&quot;  
Garon C. Smith, Md Mainul Hossain and Patrick MacCarthy
J. Chem. Ed…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface?rev=1607358147&amp;do=diff">
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        <dc:date>2020-12-07T17:22:27+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_energy_surface?rev=1607358147&amp;do=diff</link>
        <description>Surface d&#039;énergie potentielle

Historique

Eyring et Polanyi ont publié en 1931 l&#039;article On Simple Gas Reactions dans lequel ils décrivent les trajets des atomes dans la réaction  + H --&gt; H +  (échange d&#039;atomes). Ces travaux aboutiront au développement des notions de $E_{bond}= D_e [\exp(-2\beta(r-r_e))-2\exp(-\beta(r-r_e))]$$E_{ant}= \frac{D_e}{2} [\exp(-2\beta(r-r_e))+2\exp(-\beta(r-r_e))]$$r_e$$D_e$$\beta$$E_{bond}= \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+S^2_{AB}} = \frac{Q_{AB}+\alpha_{AB}}{1+k}$$E_{a…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-06-10T08:56:04+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:jupyter</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:jupyter?rev=1654844164&amp;do=diff</link>
        <description>Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab

	*  Jupyter a succédé à IPython Notebook
	*  Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C&#039;est la manière la plus adéquate d&#039;utiliser Jupyter.
	*  Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:elements_molecules?rev=1614684706&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2021-03-02T12:31:46+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:elements_molecules</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:elements_molecules?rev=1614684706&amp;do=diff</link>
        <description>Éléments et molécules

Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-02-21T14:56:20+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:presentation_principes</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:presentation_principes?rev=1676987780&amp;do=diff</link>
        <description>~~REVEAL transition=convex&amp;controls=1&amp;show_progress_bar=1&amp;build_all_lists=1&amp;open_in_new_window=1~~

Programmer en Python

Généralités

	*  Qu&#039;est-ce qu&#039;un langage de programmation ?
	*  Compilation ou interprétation, ou... ?

Rôle des langages de programmation</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux?rev=1457103767&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2016-03-04T16:02:47+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux?rev=1457103767&amp;do=diff</link>
        <description>Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux

&lt;sxh  python; title : pressions_partielles_systemes_non_ideaux.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“
Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux
Basé sur le travail de ML et VM, ba2 chimie 2013-2014</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:print_format?rev=1649474538&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-04-09T05:22:18+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:print_format</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:print_format?rev=1649474538&amp;do=diff</link>
        <description>Impressions avec la méthode .print()

FIXME :

	*  à compléter par les règles essentielles et quelques exemples
	*  F-strings introduite depuis Python 3.6 

Références

	*  &lt;https://docs.python.org/3/library/string.html#formatstrings&gt;
	*  &lt;https://pyformat.info/&gt;
	*  &lt;https://www.digitalocean.com/community/tutorials/how-to-use-string-formatters-in-python-3&gt;
	*  F-strings
		*  &lt;https://realpython.com/python-f-strings/&gt;
		*  Python’s F-Strings - Complete implementation guide with code… Naina Chatu…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:scikit_learn?rev=1521472681&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2018-03-19T16:18:01+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:scikit_learn</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:scikit_learn?rev=1521472681&amp;do=diff</link>
        <description>Scikit-learn

	*  &lt;http://scikit-learn.org&gt;
	*  &lt;http://www.innoarchitech.com/machine-learning-an-in-depth-non-technical-guide/&gt;

FIXME : ajouter des exemples avec analyse de textes contenant des termes scientifiques, des noms de substances chimiques,...

	*  Scikit-chem, simple cheminformatics for Python
	*  MolMiner, for extracting compounds from scientific literature
	*</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:maxwell-boltzmann?rev=1391051992&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2014-01-30T04:19:52+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:maxwell-boltzmann</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:maxwell-boltzmann?rev=1391051992&amp;do=diff</link>
        <description>Représentation de la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann

Pour la théorie, cf. le cours de physico-chimie ou la page Wikipédia sur la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann

Sans NumPy

&lt;sxh python; title : Maxwell-Boltzmann_01.py&gt;
#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
“”“
NumPy/Matplotib : representation de la distribution de vitesses de Maxwell-Boltzmann
version SANS utilisation de NumPy
cf cours et</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tkinter_gui_simple?rev=1674139591&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-01-19T15:46:31+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:tkinter_gui_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:tkinter_gui_simple?rev=1674139591&amp;do=diff</link>
        <description>Les bases d&#039;un interface graphique avec Tkinter

Quelques références de base pour utiliser Tkinter

	*  Documentation officielle :
		*  Les interfaces graphiques TK
			*  tkinter — interface Python à Tcl/Tk, reprenant quelques références recommandées
			*  Python 3 avec Tk intègre également les extensions</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse?rev=1582621465&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2020-02-25T10:04:25+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:potentiel_morse?rev=1582621465&amp;do=diff</link>
        <description>Potentiel de Morse

Potentiel de Morse et approximation harmonique, avec représentation des niveaux d&#039;énergie des modèles quantiques correspondants.

Code source : 


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Représentation du potentiel de Morse pour H2
http://en.wikipedia.org/wiki/Morse_potential
http://en.wikipedia.org/wiki/Quantum_harmonic_oscillator approximation harmonique
D_e = 7.6E-19 J
a = 19.3E-15 m
r_e= 74.1E-12 m
dérivée de seconde d2V/dr2 = 2 * D_e * a**2.
&quot;&quot;&quot;
import matplot…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:chempy?rev=1679311387&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2023-03-20T12:23:07+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:chempy</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:chempy?rev=1679311387&amp;do=diff</link>
        <description>ChemPy

	*  &lt;https://pypi.org/project/chempy/&gt; : installation et documentation


#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Created on Tue May  4 10:25:51 2021

@author: villersd
Librairie chempy :
https://pypi.org/project/chempy/#documentation
https://github.com/bjodah/chempy
installation Linux : conda install -c bjodah chempy pytest
installation Windows &amp; OS X :
python -m pip install chempy pytest
python -m pytest -rs -W ignore::chempy.ChemPyDeprecationWarning --pyargs chempy
&quot;&quot;&quot;
from …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:csv?rev=1613035140&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2021-02-11T10:19:00+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:csv</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:csv?rev=1613035140&amp;do=diff</link>
        <description>Lire et écrire des fichiers de données csv
pandas
Les fichiers csv sont des fichiers de données séparées par des virgules (ou point-virgules), pour “comma separated values”. Comme ceci :


1;0.1;3
2;0.3;5
3;0.5;7
4;0.6;11
5;0.9;21
6;1.5;39


Ils peuvent être facilement importés ou exportés de tableurs ou logiciels de graphiques scientifiques.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:factorielle?rev=1487924221&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2017-02-24T09:17:01+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:factorielle</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:factorielle?rev=1487924221&amp;do=diff</link>
        <description>Calcul de factorielles

La factorielle d&#039;un nombre naturel n est le produit des nombres entiers strictement positifs inférieurs ou égaux à n. Elle est notée n!. Pour n=0, on a 0!=1, ensuite 1!=1, 2!=2, 3!=6, 4!=24,...

Un premier (mauvais) programme

Regardez, et essayez</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:factorielle-2?rev=1487924363&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2017-02-24T09:19:23+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:factorielle-2</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:factorielle-2?rev=1487924363&amp;do=diff</link>
        <description>Factorielle : un premier programme

Voici un embryon non fonctionnel de programme. Il y manque des éléments (à la place des “???”)


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Calcul de la factorielle d&#039;un nombre
Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Factorielle
&quot;&quot;&quot;
# on demande le nombre :
print(&quot;Calcul de la factorielle de n&quot;)
chainelue = input(&quot;Que vaut n ? &quot;)
n = int(chainelue)
print(n)

# structure de répétition pour appliquer la définition de la factorielle
reponse=1  # la répon…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:mendeleev?rev=1668938934&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-11-20T11:08:54+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:mendeleev</title>
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        <description>Librairie Mendeleev

La librairie Mendeleev est complète et évoluée

	*  Package repository sur PyPI : &lt;https://pypi.org/project/mendeleev/&gt;
	*  Page officielle, description et code source : &lt;https://github.com/lmmentel/mendeleev&gt;
	*  Documentation complète : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/&gt;
		*  Tutoriels : &lt;https://mendeleev.readthedocs.io/en/stable/tutorials.html&gt;

	*  Notebook Jupyter (exemples) : 
		*  &lt;https://nbviewer.jupyter.org/github/lmmentel/mendeleev/blob/master/docs/sou…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus?rev=1614090814&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus</title>
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        <description>Graphe simple de sinus et cosinus

On montre en détail comment réaliser une représentation graphique simple des fonctions sinus et cosinus. Au départ le graphique utilisera les réglages par défaut et la figure sera ensuite améliorée pas à pas en commentant les instructions matplotlib utilisées.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-6?rev=1488272499&amp;do=diff">
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        <title>teaching:progappchim:polynomes-6</title>
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        <description>Polynômes : la méthode de Horner
432
Cela revient à effectuer les opérations successives suivantes :

	*  prendre le coefficient de x4
	*  multiplier par x
	*  ajouter le coefficient de x3
	*  multiplier par x
	*  ajouter le coefficient de x2
	*</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:polynomes-12?rev=1670518165&amp;do=diff">
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        <dc:date>2022-12-08T17:49:25+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:polynomes-12</title>
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        <description>Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy

Voici un programme permettant d&#039;obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l&#039;intérêt d&#039;utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l&#039;importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:rdkit?rev=1685220843&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:rdkit</title>
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        <description>RDKit

	*  &lt;http://www.rdkit.org/&gt;
	*  Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation
	*  Depict a compound as an image | Chemistry Toolkit Rosetta Wiki | Fandom
	*  Jupyter &amp; RDKit
		*  Getting Started with RDKit and Jupyter | Depth-First
		*  &lt;http://davies-lee.com/index.php/2018/10/06/rdkit-in-jupyter-notebooks/&gt;

	*  ChemSpider | Search and share chemistry site reprenant de nombreuses informations sur des molécules
	*  ...

Utilisation avec Anaconda

“”



Utili…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci?rev=1487922631&amp;do=diff">
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        <dc:date>2017-02-24T08:50:31+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:suite_de_fibonacci</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci?rev=1487922631&amp;do=diff</link>
        <description>Suite de Fibonacci

La suite de Fibonacci est une suite d&#039;entiers dans laquelle chaque terme est la somme des deux termes qui le précèdent. Elle commence généralement par les termes 0 et 1 (parfois 1 et 1) et ses premiers termes sont :  0, 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21, etc. (reference</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:algos_entiers?rev=1673337894&amp;do=diff">
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        <dc:date>2023-01-10T09:04:54+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:algos_entiers</title>
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        <description>Algorithmes sur entiers
cf.......
Cette page reprend quelques grands algorithmes classiques sur les nombres entiers, et introduit quelques algorithmes ayant des applications en chimie.

Recherche du PGCD (plus grand commun diviseur)

Explication géométrique : en comprenant un nombre entier comme une longueur et un couple d&#039;entiers (a,b) comme un rectangle, leur PGCD est la longueur du côté du plus grand carré permettant de carreler entièrement ce rectangle. L&#039;algorithme d&#039;Euclide décompose ce re…</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:analyse_images?rev=1615285540&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2021-03-09T11:25:40+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:analyse_images</title>
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        <description>Analyse d&#039;images

Le traitement d&#039;images permet de transformer des images. L&#039;analyse d&#039;images permet d&#039;extraire des informations contenues dans une image. Il est aussi possible d&#039;effectuer des tâches plus complexes de reconnaissance et d&#039;analyse de scènes.</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:attracteur_lorenz?rev=1565515580&amp;do=diff">
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        <dc:date>2019-08-11T11:26:20+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:attracteur_lorenz</title>
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        <description>L&#039;attracteur de Lorenz

L&#039;attracteur de Lorenz est un système d&#039;équations différentielles ordinaires au comportement particulier, chaotique. C&#039;est un exemple classique de nombreux cours scientifiques, et plusieurs sites proposent des solutions.

Avec du code appliquant le méthode de Runge-Kutta d&#039;ordre 4</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-09-22T16:59:55+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:bioinformatic</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:bioinformatic?rev=1663858795&amp;do=diff</link>
        <description>Bioinformatique

Un des objectifs majeurs de la bioinformatique réside dans l&#039;étude automatique de séquences, principalement de l&#039;ADN et de protéines,...

Ces séquences sont accessibles librement et publiquement, notamment par ces deux sources :

Voir aussi le site</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:collection_namedtuple_exemple?rev=1611311635&amp;do=diff">
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        <dc:date>2021-01-22T11:33:55+00:00</dc:date>
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        <title>teaching:progappchim:collection_namedtuple_exemple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:collection_namedtuple_exemple?rev=1611311635&amp;do=diff</link>
        <description>Exemple d&#039;utilisation de namedtuple

L&#039;utilisation de namedtuple peut s&#039;avérer plus rapide que la définition de classes (objets) pour gérer des petites structures de données.

La syntaxe de base est : namedtuple(typename, field_names)

	*  cela crée une sous-classe de namedtuple appelée</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:conversion_temperature_2011?rev=1392102998&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:conversion_temperature_2011</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:conversion_temperature_2011?rev=1392102998&amp;do=diff</link>
        <description>Conversion de températures

&lt;sxh python; title : convertisseur_temperature.py&gt;
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# Conversion de témpératures
# programme réalisé par AC&amp;JD, ba2 chimie 2010-2011

from Tkinter import *

def delwidgets():</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2022-03-14T17:28:30+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:openbabel_jmol</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:openbabel_jmol?rev=1647275310&amp;do=diff</link>
        <description>OpenBabel et Jmol

OpenBabel

OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats.

	*  Site officiel : &lt;http://openbabel.org/wiki/Main_Page&gt;
	*  Interfaçage en Python : &lt;http://openbabel.org/wiki/Python&gt;

Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff">
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        <dc:date>2022-03-08T09:43:21+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:pylab_simple</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:pylab_simple?rev=1646729001&amp;do=diff</link>
        <description>Pylab

Pylab permet de combiner simplement Matplotlib, NumPy et SciPy, en utilisant une directive d&#039;importation supprimant l&#039;usage de tous les namespaces des librairies sous-jacentes :

from pylab import *

Exemple

Version “Pylab” du code utilisé pour la</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2?rev=1487922675&amp;do=diff">
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        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2?rev=1487922675&amp;do=diff</link>
        <description>Suite de Fibonacci : un premier programme

Voici un embryon non fonctionnel de programme. Il y manque alors des éléments (à la place des “???”)


#! /usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
&quot;&quot;&quot;
Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci.
Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci
&quot;&quot;&quot;
# élément d&#039;indice 0
i = 0
a = 0
print(i,a)
# élément d&#039;indice 1
i = 1
b = 1
print(i,b)

# structure de répétition pour appliquer la règle de récurrence
max = 100 # indice du dernier …</description>
    </item>
    <item rdf:about="https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff">
        <dc:format>text/html</dc:format>
        <dc:date>2015-05-12T10:04:44+00:00</dc:date>
        <dc:creator>Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com)</dc:creator>
        <title>teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co</title>
        <link>https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:progappchim:matplotlib_gallery:ir_spectrum_co?rev=1431417884&amp;do=diff</link>
        <description>Spectre IR du CO

Différentes techniques de spectroscopie utilisent des représentations standardisées des spectres. En spectroscopie Infrarouge, l&#039;absorbance est traditionnellement représentée en fonction des nombres d&#039;ondes décroissants exprimés en $cm^{-1}$. Pour rappel, en spectroscopie, le $\tilde{\nu}$$\tilde{\nu} = 1/\lambda = \nu/c$$\Delta J = \pm 1$$cm^{-1}$</description>
    </item>
</rdf:RDF>
