teaching:progappchim:calcul_matriciel_2012

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T12:33:31+00:00

Calul matriciel #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- # (pdf) # #pour operation matriciel verification mathématique : # #

teaching:progappchim:chempy

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-03-20T12:23:07+00:00

ChemPy * : installation et documentation #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Tue May 4 10:25:51 2021 @author: villersd Librairie chempy : https://pypi.org/project/chempy/#documentation https://github.com/bjodah/chempy installation Linux : conda install -c bjodah chempy pytest installation Windows & OS X : python -m pip install chempy pytest python -m pytest -rs -W ignore::chempy.ChemPyDeprecationWarning --pyargs chempy """ from …

teaching:progappchim:chemspipy

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-03T12:13:30+00:00

ChemSpiPy * Utilisation des données de ChemSpider * site officiel * : documentation officielle * Avec la distribution Anaconda, la lirairie “chemspipy” est installable via le canal “conda-forge”. Utiliser si opportun un environnement spécifique.

teaching:progappchim:codes_presentation

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-01-28T17:58:41+00:00

Codes de la présentation Turtle Cf. la documentation officielle. #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*- # exemple de base turtle # from turtle import * import sys import time reset() x=-100 y=-100 i=0 while i < 10: j=0 while j <10: up() goto(x+i*20,y+j*20) down() fill(1) n=0 while n <4 : forward(16) left(90) n=n+1 color([i*0.1,j*0.1,0]) fill(0) color(0,0,0) j=j+1 …

teaching:progappchim:collection_counter_exemple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-01-18T11:49:53+00:00

Exemple d'utilisation de Counter Module collections : * * #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Recherche du nombre d'occurences des noms d'auteurs d'un article On copie dans all_authors les noms des auteurs http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26799652 """ import collections all_authors = "Klionsky DJ, Abdelmohsen K, Abe A, Abedin MJ, Abeliovich H,..." authors = all_auth…

teaching:progappchim:collection_namedtuple_exemple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-01-22T11:33:55+00:00

Exemple d'utilisation de namedtuple L'utilisation de namedtuple peut s'avérer plus rapide que la définition de classes (objets) pour gérer des petites structures de données. La syntaxe de base est : namedtuple(typename, field_names) * cela crée une sous-classe de namedtuple appelée

teaching:progappchim:conversion_temperature_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-02-11T08:16:38+00:00

Conversion de températures #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Conversion de témpératures # programme réalisé par AC&JD, ba2 chimie 2010-2011 from Tkinter import * def delwidgets():

teaching:progappchim:courbe_predominance_acide_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-28T14:18:09+00:00

Courbe de Prédominance d'un Acide #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # travail de KH, ba2 chimie 2012-2013 # Courbe de Prédominance d'un Acide # from math import * import matplotlib.pyplot as plt from Tkinter import *

teaching:progappchim:csv

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-11T10:19:00+00:00

Lire et écrire des fichiers de données csv pandas Les fichiers csv sont des fichiers de données séparées par des virgules (ou point-virgules), pour “comma separated values”. Comme ceci : 1;0.1;3 2;0.3;5 3;0.5;7 4;0.6;11 5;0.9;21 6;1.5;39 Ils peuvent être facilement importés ou exportés de tableurs ou logiciels de graphiques scientifiques.

teaching:progappchim:dictionaries_adn_arn_protein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-04T16:14:25+00:00

Traduction ADN-ARN-protéine Avec l'interface Tk. Voir aussi le programme Traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés (protéine) : utilisation d'un dictionnaire (type Python) #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“ Traduction de codes ADN en ARN et protéine. Basé sur le travail de NR et CVDD, ba2 chimie 2013-2014

teaching:progappchim:dictionary_adn_protein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2012-11-30T13:28:07+00:00

Traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés #!/usr/bin/env python # -*- coding: iso-8859-1 -*- # python code to translante DNA sequences into proteins # traduction de l'ADN en séquence d'acides aminés (protéine)

teaching:progappchim:diffusion_chimique_1d

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-01-15T13:48:26+00:00

Modélisation de la diffusion chimique dans un film Technique de différences finies, utilisation de matplotlib #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- from math import * # pour utiliser la librairie graphique matplotlib from pylab import *

teaching:progappchim:elements_molecules

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-02T12:31:46+00:00

Éléments et molécules Les propriétés des éléments chimiques, de molécules peuvent être dressées, listées,... par un programme si on dispose des données. Celles-ci étant communes à tous les chimistes, et uniquement susceptibles de quelques modifications, il est utile de reprendre une source commune primaire (IUPAC) ou secondaire (comme Wikipedia) plutôt que de redéfinir toutes ces valeurs dans un programme.

teaching:progappchim:ensemble_mandelbrot_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-03-02T17:01:15+00:00

Ensemble de Mandelbrot Dessin d'une fractale : l'ensemble de Mandelbrot #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # version un peu aménagée du travail de BF, ba2 chimie 2012-2013 # ref : from Tkinter import * from random import randrange

teaching:progappchim:entropie_melange

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-09T11:24:33+00:00

Entropie de mélange pour un gaz ou liquide idéal #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ représentation graphique de l'entropie de mélange d'un système idéal """ import numpy as np # voir http://docs.scipy.org/doc/ import matplotlib.pyplot as plt def s(t): return t*np.log(t) + (1-t) * np.log(1-t) x1 = np.arange(0.0, 1., 0.001) plt.plot(x1, s(x1), 'b-') #plt.plot(x1, x1*np.log(x1) + (1-x1) * np.log(1-x1), 'b-') #autre façon, n'utilisant pas la fonction plt.show() # des m…

teaching:progappchim:epidemie_coronavirus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-07-13T04:04:29+00:00

Épidémie du coronavirus COVID-19 Références : * Coronavirus disease 2019 * Maladie à coronavirus 2019 * Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE * Coronavirus (COVID-19) Mortality Rate * data : Programmes de représentations FIXME Quelques simulations SEIR effectuées par des scientifiques : * Marius Gilbert (ULB/FNRS, Spatial Epidemiology lab (SpELL),

teaching:progappchim:factorielle-2

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:19:23+00:00

Factorielle : un premier programme Voici un embryon non fonctionnel de programme. Il y manque des éléments (à la place des “???”) #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calcul de la factorielle d'un nombre Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Factorielle """ # on demande le nombre : print("Calcul de la factorielle de n") chainelue = input("Que vaut n ? ") n = int(chainelue) print(n) # structure de répétition pour appliquer la définition de la factorielle reponse=1 # la répon…

teaching:progappchim:factorielle-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:28:44+00:00

Factorielle : une fonction en Python Voici une version avec la fonction factorielle() #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calcul de la factorielle d'un nombre Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Factorielle """ def factorielle(arg_n): """ structure de répétition pour appliquer la définition de la factorielle """ reponse = 1 # la réponse sera dans la variable reponse i = 1 # on va commencer par 1 while i <= arg_n: …

teaching:progappchim:factorielle-4

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-02-23T11:42:30+00:00

Factorielle : travaux additionnels Idées d'exercices complémentaires, d'applications. Utilisation d'un dictionnaire Il peut être intéressant de précalculer des factorielles qui seront mémorisées dans un dictionnaire. Comparaison avec l'approximation de Stirling

teaching:progappchim:factorielle

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:17:01+00:00

Calcul de factorielles La factorielle d'un nombre naturel n est le produit des nombres entiers strictement positifs inférieurs ou égaux à n. Elle est notée n!. Pour n=0, on a 0!=1, ensuite 1!=1, 2!=2, 3!=6, 4!=24,... Un premier (mauvais) programme Regardez, et essayez

teaching:progappchim:fit_modele_einstein

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-04-01T15:47:31+00:00

Optimisation de la température caractéristique du diamant suivant le modèle d'Einstein Ce modèle prévoie la dépendance à la température de la capacité calorifique d’un solide cristallin. La détermination de la température caractéristique nécessite de

teaching:progappchim:fizz_buzz

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T14:35:03+00:00

Fizz buzz Fizz buzz est un jeu de comptage et de divisibilité conçu pour des enfants. Les joueurs comptent à tour de rôle en incrémentant, partant de 1, et remplaçant chaque nombre divisible par 3 par le mot “fizz”, et chaque mot divisible par 5 par le mot

teaching:progappchim:game_of_life_conway-2012

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-09T11:29:49+00:00

Jeu de la vie de Conway Game of Life with Python #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """A minimal implementation of Conway's Game of Life. source : http://www.exolete.com/code/life modified by par Jérémie Knoops, BA2 chimie UMONS, 2011-2012 cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Jeu_de_la_vie & http://en.wikipedia.org/wiki/Conway%27s_Game_of_Life Each cell's survival depends on the number of occupied nearest and next-nearest neighbours (calculated in Grid::step). A living cell dies of ov…

teaching:progappchim:gaz_parfait_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-02-11T09:05:52+00:00

Loi des gaz parfaits #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Programme de calculs sur la loi des gaz parfaits # GD, Ba2 chimie 2010-2011 from Tkinter import * #permet l'apparition de l'interface graphique

teaching:progappchim:glossaire_chimie

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-04-29T12:13:50+00:00

Glossaire de chimie Cf. le glossaire de chimie #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Utilisation du glossaire https://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching:glossaire-chimie Le code dokuwiki source doit être sauvegardé dans un fichier glossaire-dokuwiki.txt Programme de base à modifier/compléter. """ from pathlib import Path home = str(Path.home()) # fichier d'entrée with open(home + "/tempo/glossaire-dokuwiki.txt", "r") as ifile: lines = ifile.readlines() ifile.close() …

teaching:progappchim:grille_configurations_melange_binaire_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T11:05:09+00:00

Création d'une grille et de configurations d'un système binaire modélisé #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # travail de ML et MP, ba2 chimie 2012-2013 # Création d'une grille et de configurations d'un système binaire modélisé

teaching:progappchim:jupyter

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-06-10T08:56:04+00:00

Jupyter, IPython Notebooks et JupyterLab * Jupyter a succédé à IPython Notebook * Jupyter est installé par défaut avec la distribution python Anaconda. C'est la manière la plus adéquate d'utiliser Jupyter. * Sinon, on peut utiliser facilement les notebooks Jupyter sur la plateforme

teaching:progappchim:koch_snowflake

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-03-07T14:37:23+00:00

Flocon de Koch Courbe fractale créée suivant un principe de récursivité, en utilisant la librairie turtle #!/usr/bin/env python # -*- coding: iso-8859-1 -*- # exemple de courbe fractale (Koch) # cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Flocon_de_von_Koch # et http://en.wikipedia.org/wiki/Koch_snowflake # ce programme est basé sur un principe de récursivité # (une fonction qui s'appelle elle-même) from turtle import * # module turtle. Doc : http://docs.python.org/library/turtle.html from time impo…

teaching:progappchim:lennard-jones

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-03-05T12:14:55+00:00

Représentation du potentiel de Lennard-Jones L'utilisation de fonctions en python permet de nombreuses applications par la création de graphiques. En utilisant la “bibliothèque matplotlib/pylab”, vous pourrez donc aisément créer des graphes de fonction.$V_{LJ} = 4\varepsilon \left[ \left(\frac{\sigma}{r}\right)^{12} - \left(\frac{\sigma}{r}\right)^{6} \right] = \varepsilon \left[ \left(\frac{r_{m}}{r}\right)^{12} - 2\left(\frac{r_{m}}{r}\right)^{6} \right]$$r_{m} = 2^{1/6} \sigma$$U_{tot} = \fr…

teaching:progappchim:math_nombres

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-01-14T13:58:23+00:00

Mathématiques et nombres Quelques programmes et algorithmes reliés aux mathématiques et aux nombres. * Théorie des nombres * Nombre_remarquable * ... Calculs en précision arbitraire * 1/9² = 0.0123456790123456790123456790123456790123456790123457... * 1/99² = 0.0001020304050607080910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697990001020304050607080910111$…

teaching:progappchim:matplotlib_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-07-11T07:46:36+00:00

Les bases de Matplotlib, une librairie pour réaliser des graphiques 2D Matplotlib est une bibliothèque très puissante du langage de programmation Python destinée à tracer et visualiser des données sous formes de graphiques. Elle est souvent combinée avec les bibliothèques python de calcul scientifique :

teaching:progappchim:matrices

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2018-03-06T14:49:57+00:00

Manipulations de matrices Les matrices sont des tableaux de nombres à deux dimensions. On peut utiliser des listes de lignes, qui sont elles-mêmes des listes d'éléments de la ligne, pour représenter une matrice. On aura donc des listes de listes.

teaching:progappchim:maxwell-boltzmann

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-01-30T04:19:52+00:00

Représentation de la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann Pour la théorie, cf. le cours de physico-chimie ou la page Wikipédia sur la distribution de vitesse de Maxwell-Boltzmann Sans NumPy #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“ NumPy/Matplotib : representation de la distribution de vitesses de Maxwell-Boltzmann version SANS utilisation de NumPy cf cours et

teaching:progappchim:mendeleev

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-11-20T11:08:54+00:00

Librairie Mendeleev La librairie Mendeleev est complète et évoluée * Package repository sur PyPI : * Page officielle, description et code source : * Documentation complète : * Tutoriels : * Notebook Jupyter (exemples) : *

teaching:progappchim:multilateration

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-07-28T05:21:15+00:00

Multilateration Références * * * dépendance : * Trilateration * True-range multilateration * * *

teaching:progappchim:nim

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-08-23T15:55:30+00:00

Jeux de Nim * fr:Jeux_de_Nim * Nim: A Game Playing Program Seymour Papert, MIT Artificial Intelligence Memo No. 254, 1970 (from The Collected Writings of Seymour Papert) * version de l'article sur archive.org, version texte disponible FIXME : codes python... Références * évolution du jeu, javascript en ligne * vidéo sur l'élaboration d'un programme en python

teaching:progappchim:notions_avancees

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-02T10:36:36+00:00

Notions avancées En construction. Les liens sont juste donnés. Une introduction et un exemple devrait être proposé pour chaque rubrique, et le nombre de ces rubriques augmenté. Itérateurs Itertools, zip,... * 7 Levels of Using the Zip Function in Python * itertools.cycle() est une méthode utile pour répéter ou parcourir sans fin les éléments d'une liste ou d'une table itérativitertools.accumulate()

teaching:progappchim:notions_fondamentales

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-03T08:39:20+00:00

Notions fondamentales Aide mémoire synthétique sur le langage Python. Règles de base Ces règles peuvent être testées via le mode interactif de Python (en utilisant la fenêtre “Shell” ou console de l'éditeur Idle ou Idle3 par exemple).

teaching:progappchim:numpy_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-03-07T13:05:54+00:00

Les bases de NumPy NumPy est une extension du langage de programmation Python, destinée à manipuler des matrices ou tableaux multidimensionnels ainsi que des fonctions mathématiques opérant sur ces tableaux. Chaque élément d'un tableau numpy occupe un nombre fixe d'octets, associé à un type particulier de donnée (data-type, ou dtype). Les types les plus courants incluent les entiers, bytes, entiers courts, booléens, nombres en virgule flottante, nombres complexes,

teaching:progappchim:openbabel_jmol

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-14T17:28:30+00:00

OpenBabel et Jmol OpenBabel OpenBabel est un ensemble de programme permettant de manipuler et convertir les fichiers de description de molécules dans différents formats. * Site officiel : * Interfaçage en Python : Pour utiliser OpenBabel en python, il faut installer au préalable ces outils. Sous Linux (Debian, Ubuntu,

teaching:progappchim:open_chemical_databases

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-04-29T12:31:48+00:00

Bases de données libres en chimie Références Databases, databank * Chemical databases +... * * * * * Données de wikipedia * Chembox template * * *

teaching:progappchim:osm_interrogation

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2015-01-15T13:38:34+00:00

Interrogation de la base de données géolocalisées OpenStreetMap API OSM en Python * Application Programming Interface, en Python Installation via pip : pip(3) install osmapi Exemple de code Recherche de débit de boissons (“pub”) via la base de données d'OpenStreetMap. #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*-

teaching:progappchim:pandas

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-11-15T10:08:25+00:00

Pandas Module pour l'analyse de données, pouvant se substituer à l'utilisation d'un tableur. Une différence fondamentale de la librairie pandas avec NumPy, c'est que les tableaux NumPy (NumPy arrays) ont le même type (dtype) pour le tableau entier, tandis que les tableaux pandas (pandas DataFrames) sont caractérisés par un type unique (dtype) par colonne.$X$$x$$P(x)$$X$$x$$x_1, x_2, x_3, ...$$X$$P(x_i)$$X$$x$$P(x)$$x$$x+dx$$P(x)$$x$$P(x) dx$$P(x) dx = P(x \le X < x+dx)$$P(x_i) \ge 0$$x_i$$P(x) …

teaching:progappchim:parsing_chemical_formula

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T15:12:00+00:00

Décomposition de formules chimiques Analyse de chaînes de caractères formées par la concaténation de symboles d'éléments chimiques. Problème de base * Décomposer une chaîne de caractères formée par des symboles chimiques répétés : CaClCNOSbInAsFICl

teaching:progappchim:pavage_penrose_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-28T14:08:53+00:00

Pavage de Penrose #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # réference : # version un peu aménagée du travail de EC et LP, ba2 chimie 2012-2013 import math import cmath import cairo # definir le nombre d'or goldenRatio = (1 + math.sqrt(5)) / 2

teaching:progappchim:periodical_table_electronegativity

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-04-01T09:26:52+00:00

Vue 3D de l'électronégativité #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Periodical table 3D view of electronegativity """ from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np data = np.array([ [2.2,1,0.9,0.8,0.8,0.8,0.7], [0,1.6,1.3,1,1,0.9,0.9], [0,0,0,1.4,1.2,1.3,0], [0,0,0,1.5,1.3,1.3,0], [0,0,0,1.6,1.6,1.5,0], [0,0,0,1.6,2.2,2.4,0], [0,0,0,1.6,1.9,1.9,0], [0,0,0,1.8,2.2,2.2,0], [0,0,0,1.9,2.3,2.2,0], [0,0,0,1.8,2.2,2.3,0], [0,0,0,1.9,1.9,2.5…

teaching:progappchim:ph-3d

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-16T09:27:32+00:00

Représentation 3D du pH Cas d'un acide en fonction d'un ajout de base et d'une dilution globale : cf. cet article #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Use of numpy polynomes to compute pH of weak acid and strong base 3D topographic surface generation in the same conditions as the following paper : 3-D Surface Visualization of pH Titration “Topos”: Equivalence Point Cliffs, Dilution Ramps, and Buffer Plateaus" Garon C. Smith, Md Mainul Hossain and Patrick MacCarthy J. Chem. Ed…

teaching:progappchim:ph_acides_bases_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-29T11:16:13+00:00

Représentation de pH d'acides et de bases Pour les acides : #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # travail de QD et TB, ba2 chimie 2012-2013 import Tkinter as tk from numpy import * import matplotlib.pyplot as plt

teaching:progappchim:ph_courbe_titrage_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-11T17:53:07+00:00

pH et courbe de titrage #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Programme de calculs de pH et de courbes de titrages # AD & BW, Ba2 chimie 2010-2011 from math import * from Tkinter import * import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np def pol(): #on définit la fonction pour le bouton "Calcul du pH" try: ca = e0.get() #permet de récupérer les valeurs entrées dans les champs d'entrée par l'utilisateur …

teaching:progappchim:pieges

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-05-15T22:47:49+00:00

Pièges à éviter Quelques pièges à éviter ! Type de données * travailler avec des nombres et ne pas mettre le point décimal s'ils ont une valeur entière les laissera dans le type 'int'. * Ne pas confondre une liste contenant un nombre, et ce nombre.

teaching:progappchim:plotly_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-02T10:38:45+00:00

Les bases de Plotly Plotly ( est une société développant des outils analytiques et de visualisation. La librairie python Plotly permet de créer des graphes dans l'environnement de Jupyter. FIXME : à compléter Références * plot.ly, le site officiel

teaching:progappchim:plot_sinus_cosinus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-02-23T15:33:34+00:00

Graphe simple de sinus et cosinus On montre en détail comment réaliser une représentation graphique simple des fonctions sinus et cosinus. Au départ le graphique utilisera les réglages par défaut et la figure sera ensuite améliorée pas à pas en commentant les instructions matplotlib utilisées.

teaching:progappchim:polynomes-2

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:13:40+00:00

Polynômes : évaluation #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynômes """ x = 3. # variable en laquelle on veut évaluer le polynôme a = [2.5, 6., 1.2, 3, 5] # la liste des coefficients, par ordre croissant n = len(a) - 1 # l'ordre du polynôme print(x,a,n) p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes print(p)

teaching:progappchim:polynomes-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:11:41+00:00

Polynômes : fonction pour évaluer #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a) - 1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p # premier exemple d'utilisation …

teaching:progappchim:polynomes-4

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:16:13+00:00

Polynômes : structure de répétition (boucle for) #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a) - 1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p varx = 0.5 varc…

teaching:progappchim:polynomes-5

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:18:12+00:00

Polynômes : boucle for, fonction mathématique #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ from math import * def polyeval(x,a): """ Fonction s'occupant uniquement de l'évaluation du polynome fonction de x avec les coefficients dans la liste a """ n = len(a)-1 p = 0. # initialisation for i in range(n+1): p = p + a[i] * x**i #calcul et addition de chacun des termes return p …

teaching:progappchim:polynomes-6

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T10:01:39+00:00

Polynômes : la méthode de Horner 432 Cela revient à effectuer les opérations successives suivantes : * prendre le coefficient de x4 * multiplier par x * ajouter le coefficient de x3 * multiplier par x * ajouter le coefficient de x2 *

teaching:progappchim:polynomes-7-contrib1

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2012-11-15T16:03:25+00:00

Polynômes : version alternative pour l'addition Proposition de BF, étudiant ba2 2012-2013. Le principe est d'additionner les termes tant qu'on est en dessous du degré maximum du polynôme de degré minimum ! et en complétant ensuite par les coefficients de degré supérieur du polynôme de degré maximum

teaching:progappchim:polynomes-7

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-02-25T11:06:31+00:00

Polynômes : comment les multiplier par un scalaire et les additionner #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes + fonction de multiplication d'un polynôme pas un scalaire + fonction d'addition de deux polynômes """ from math import * def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a) - 1 # n = ordre du polynôme p =0. for…

teaching:progappchim:polynomes-8

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:43:18+00:00

Polynômes : graphes de fonctions polynomiales #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ écriture d'un programme pour évaluer des polynomes """ from math import * from pylab import * # librairies de graphiques (matplotlib) def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynome p = 0. for i in range(n,-1,-1): p = p*x + a[i] return p def…

teaching:progappchim:polynomes-9

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:45:14+00:00

Polynômes : graphe multiple fonctions polynomiales # -*- coding: utf-8 -*- """ graphe multiple de polynômes de Tchebyshev cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/Polyn%C3%B4me_de_Tchebychev """ from pylab import * # librairie graphique (Matplotlib) def polyeval(x,a): """ application de l'agorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynôme p = 0. for i in range(n,-1,-1): p = p*x + a[i] …

teaching:progappchim:polynomes-10

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:53:33+00:00

Polynômes : fonctionnalités supplémentaires Voici quelques fonctions utiles pour manipuler les polynômes : Dérivation Proposé et testé par RL, étudiant ba2 2012-2013. #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- def polyderiv(a): """ dérivation d'un polynôme """ b = a[:] #copie de la liste des coefficients du polynôme de départ n = len(b) -1 #ordre du polynôme for i in range (n+1): b[i] = b[i] * i #on redéfinit chaque coefficient i de la liste par ce…

teaching:progappchim:polynomes-11

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T11:58:51+00:00

Graphe d'une famille de polynômes orthogonaux Voici un programme permettant de visualiser les premiers polynômes orthogonaux de Tchebyshev : #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ graphes de Polynomes de Chebyschev """ from math import * from pylab import * def polyeval(x,a): """ application de l'algorithme de Horner cf. http://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Ruffini-Horner """ n = len(a)-1 # n = ordre du polynome p = 0. for i in range(n,-1,-1): …

teaching:progappchim:polynomes-12

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-12-08T17:49:25+00:00

Utilisation de polynômes orthogonaux avec NumPy Voici un programme permettant d'obtenir le même graphe que celui obtenu précédemment, en utilisant les modules spécifiques de NumPy. Cet exemple montre tout l'intérêt d'utiliser des modules pré-existants. Le programme est réduit à 3 lignes pour l'importation, 4 pour la création des graphes et 4 pour commander la représentation.

teaching:progappchim:polynomes-bonus

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-01T14:36:46+00:00

Polynômes : bonus Décomposition d'un polynôme en somme de deux polynômes, pair et impair #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- """ décomposition d'un polynôme en deux polynômes, respectivement pair et impair, qui par sommation rendent le polynôme intial """ def polyadd(a,b): """ Addition de deux polynômes de coefficients a et b """ r = a[:] # on travaille sur une copie de a pour ne pas le modifier t = b[:] # idem pour b g = [] # polynôme som…

teaching:progappchim:polynomes

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-28T09:27:43+00:00

Polynômes Travail avec des polynômes : * un polynôme est une fonction * un polynôme est caractérisé de manière univoque par ses coefficients * le degré d'un polynôme est l'exposant qui caractérise le terme de puissance la plus élevée

teaching:progappchim:ppoo

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-01-28T16:31:18+00:00

Programmation Python Orientée Objet FIXME : en construction Concepts utilisés * Un objet : c'est... n'importe quoi, qui peut être codé. En Python, tout est objet ! * Une classe est une description générique d'un type d'objet, incluant les données et les méthodes qui le caractérisent

teaching:progappchim:presentation_principes

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-02-21T14:56:20+00:00

~~REVEAL transition=convex&controls=1&show_progress_bar=1&build_all_lists=1&open_in_new_window=1~~ Programmer en Python Généralités * Qu'est-ce qu'un langage de programmation ? * Compilation ou interprétation, ou... ? Rôle des langages de programmation

teaching:progappchim:pressions_partielles_systemes_non_ideaux

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-04T16:02:47+00:00

Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“ Graphiques des pressions partielles de systèmes non-idéaux Basé sur le travail de ML et VM, ba2 chimie 2013-2014

teaching:progappchim:print_format

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-04-09T05:22:18+00:00

Impressions avec la méthode .print() FIXME : * à compléter par les règles essentielles et quelques exemples * F-strings introduite depuis Python 3.6 Références * * * * F-strings * * Python’s F-Strings - Complete implementation guide with code… Naina Chatu…

teaching:progappchim:pubchempy

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-15T11:20:05+00:00

PubChemPy * Documentation : Utilisation dans Colaboratory * Créer une première cellule de code permettant l'installation de la librairie PubChemPy : !pip install pubchempy * Fichier exemple :

teaching:progappchim:pygal_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-06-20T14:57:35+00:00

Les bases de Pygal FIXME Références * * Why use pygal?

teaching:progappchim:pylab_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-08T09:43:21+00:00

Pylab Pylab permet de combiner simplement Matplotlib, NumPy et SciPy, en utilisant une directive d'importation supprimant l'usage de tous les namespaces des librairies sous-jacentes : from pylab import * Exemple Version “Pylab” du code utilisé pour la

teaching:progappchim:random_walk_2d-simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-03-09T11:22:18+00:00

Marche aléatoire 2D simple Dans les modèles les plus simples, on considère un polymère comme un ensemble de segments faisant entre eux un angle quelconque (freely jointed chain). Ce problème est aussi dénommé “marche aléatoire” (random walk) en mathématique ou physique. Il peut aussi rendre compte d'autres phénomènes tel que celui de la diffusion. Après simulation, vous comprendrez pourquoi on appelle

teaching:progappchim:rdkit

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-05-27T22:54:03+00:00

RDKit * * Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation * Depict a compound as an image | Chemistry Toolkit Rosetta Wiki | Fandom * Jupyter & RDKit * Getting Started with RDKit and Jupyter | Depth-First * * ChemSpider | Search and share chemistry site reprenant de nombreuses informations sur des molécules * ... Utilisation avec Anaconda “” Utili…

teaching:progappchim:recherches

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-16T16:45:40+00:00

Algorithmes de recherche Classiquement, pour des données structurées en listes, arbres, un algorithme de recherche va selon un critère donné (une valeur par exemple) retourner un ensemble d'occurrences (toutes, plusieurs, une seule,...). Recherche séquentielle

teaching:progappchim:regression_lineaire_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2013-11-28T13:38:41+00:00

Régression linéaire Entrée de couples, calcul et affichage de la droite de moindres carrés #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # version un peu aménagée du travail de BD et EH, ba2 chimie 2012-2013 import matplotlib.pyplot as plt import pylab import numpy

teaching:progappchim:representation_molecules_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-03-09T14:42:50+00:00

Représentation de molécules Page à actualiser... Certaines fonctions de ce programme nécessite des fichiers de données : [base.csv] et [bdd.csv] #!/usr/bin/env python # -*- coding: UTF-8 -*- # travail de RL, ba2 chimie 2012-2013

teaching:progappchim:scikit_learn

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2018-03-19T16:18:01+00:00

Scikit-learn * * FIXME : ajouter des exemples avec analyse de textes contenant des termes scientifiques, des noms de substances chimiques,... * Scikit-chem, simple cheminformatics for Python * MolMiner, for extracting compounds from scientific literature *

teaching:progappchim:scipy_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2019-03-22T12:07:33+00:00

Les bases de SciPy La librairie SciPy ajoute à NumPy des fonctionnalités mathématiques. Directive d'importation * Méthode standard : import scipy as sp * Importation par sous-modules (cf le site de Scipy) : from scipy import optimize from scipy import interpolate from scipy import integrate ...

teaching:progappchim:slices

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-01-02T10:15:18+00:00

Slices sur les séquences L'utilisation des “slices” ou du “slicing” sur les listes, ou sur tout objet en séquence (tuple, chaîne de caractères, ...) permet de “découper” des sous-listes. Si la séquence s'appelle sequence_name, la syntaxe du slice est : sequence_name[start:stop:step] où start est l'indice du premier élément (par défaut 0), stop est l'indice du premier élément NON REPRIS (par défaut len(seq

teaching:progappchim:solubilite_ph_t

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2016-03-04T15:24:32+00:00

Solubilité en fonction du pH et de la température Interface en ligne de commande et graphiques matplotlib Nécessite [ce fichier de données] (à décompresser). #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- “”“

teaching:progappchim:solvents_data_class

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2012-11-30T13:39:08+00:00

Utilisation d'une "classe" pour des données de solvants chimiques On peut utiliser la structure de classe pour créer une “table” de données sur des solvants. Il est alors possible d'effectuer des traitements de tris, sélection, impression...

teaching:progappchim:start

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-03-13T10:14:25+00:00

Programmation appliquée à la chimie Aux dernières nouvelles (14/12/2022) Serhiy Storchaka vit toujours en Ukraine, à 20 km de Konotop !! Le cours “Programmation appliquée à la chimie” de bachelier en sciences chimiques (15 H cours et 15 H exercices, bloc2) utilise deux supports :

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-2

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T08:51:15+00:00

Suite de Fibonacci : un premier programme Voici un embryon non fonctionnel de programme. Il y manque alors des éléments (à la place des “???”) #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci """ # élément d'indice 0 i = 0 a = 0 print(i,a) # élément d'indice 1 i = 1 b = 1 print(i,b) # structure de répétition pour appliquer la règle de récurrence max = 100 # indice du dernier …

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-3

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T08:52:04+00:00

Suite de Fibonacci : écriture de fonctions Voici la structure que doit avoir un programme pour lequel le calcul de l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci est encapsulé dans une fonction : #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci """ def fibonacci_item(n): """ Renvoie l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci """ ... if __name__ == '__main__'…

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-4

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T09:09:35+00:00

Suite de Fibonacci : encore un algorithme Voici le programme complété pour la technique récursive : #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci Application de la définition par récursivité. """ def fibonacci_item_recursive(n): """ Renvoie l'élément d'indice n de la suite de Fibonacci """ if n == 0: return 0 elif n == 1: return 1 ret…

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci-5

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-05-30T00:13:09+00:00

Suite de Fibonacci : quel est le meilleur algorithme ? Comparer les temps avec timeit La librairie timeit mesure les temps d'exécution en évitant des biais tels que l'usage concomitant d'autres ressources. #! /usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ Calculs des premiers éléments de la suite de Fibonacci. Référence : http://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci Comparaison de différentes fonctions avec Timeit http://docs.python.org/2/library/timeit.html http://www.diveintopython.net…

teaching:progappchim:suite_de_fibonacci

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-02-24T08:50:31+00:00

Suite de Fibonacci La suite de Fibonacci est une suite d'entiers dans laquelle chaque terme est la somme des deux termes qui le précèdent. Elle commence généralement par les termes 0 et 1 (parfois 1 et 1) et ses premiers termes sont : 0, 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21, etc. (reference

teaching:progappchim:t-test

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2014-07-03T16:17:41+00:00

Test de Student Le test de Student (t-test) teste statistiquement l’hypothèse d’égalité de l'espérance de deux variables aléatoires suivant une loi normale et de variance inconnue. Références * (des exemples simples) * Documentation Python sur stats de scipy * 1-sample t-test * Unpaired t-test * Paired t-test

teaching:progappchim:tableau_periodique_2011

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2021-04-19T21:00:29+00:00

Tableau périodique FIXME : importation de la librairie tkinter à unifier + codes à améliorer #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Programme sur le tableau périodique # MJ, Ba2 chimie 2010-2011 from tkinter import * from element_liste import * #sert à importer la liste présente dans l'autre fichier #création de la commande générale du boutton def elem(x): element=Tk() element.title("Proprietes") listbox=Listbox(element,height=10,width=40,fg="#070942") listbox.pack(…

teaching:progappchim:tableau_periodique_2013

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2020-04-14T12:03:16+00:00

Tableau périodique Tableau avec éléments cliquables pour obtenir les information. Nécessite [ce fichier de données]. #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # version un peu aménagée du travail de TD et SD, ba2 chimie 2012-2013 def elem(x): # print type(x),x # pour montrer que x est une chaîne de caractères element=Tk() element.title("Propriété du"+ x ) elembox=Listbox(element,height=32,width=40,fg="#070942") elembox.pack() for item in table[int(x)]: …

teaching:progappchim:testjs

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2017-05-04T16:13:28+00:00

Test Javascript + dokuwiki + DataCamp-light

This is a python exercise !!


      import numpy as np
      x = np.arange(0, 5, 0.1);
      y = np.sin(x)
      print(x)
      print(y)

…

teaching:progappchim:tkinter_gui_simple

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-01-19T15:46:31+00:00

Les bases d'un interface graphique avec Tkinter Quelques références de base pour utiliser Tkinter * Documentation officielle : * Les interfaces graphiques TK * tkinter — interface Python à Tcl/Tk, reprenant quelques références recommandées * Python 3 avec Tk intègre également les extensions

teaching:progappchim:tris

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-12-09T14:25:44+00:00

Algorithmes de tri Un algorithme de tri est, en informatique ou en mathématiques, un algorithme qui permet d'organiser une collection d'objets selon un ordre déterminé (Référence wikipedia). Les tris sont intéressants du point de vue de l'apprentissage de l'algorithmique.

teaching:progappchim:trucs_astuces

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2023-04-30T11:09:36+00:00

Trucs et astuces * Fusionner deux dictionnaires * 0 Python Best Practices, Tips, And Tricks - Improve your Python knowledge and skills Erik van Baaren, Medium, Jan 5, 2020 * Apply These 4 Techniques To Write Concise Python Code - Write Python code in a Pythonic way, Yong Cui, Medium, 09/03/2021 * Python refactoring tips for cleaner code, Pralabh Saxena, Medium, Jul 26 2021 * 10 Python Snippets I Use Every Day - A few Python snippets - from sorting to list comprehensions - that I use n…

teaching:progappchim:urllib

Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) — 2022-03-21T15:46:48+00:00

Lecture du code source d'une page web via la librairie urllib #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- """ exemple de programme pour obtenir le code d'une page avec la librairie urllib source : https://realpython.com/python-web-scraping-practical-introduction/ """ from urllib.request import urlopen site_url = 'https://dvillers.umons.ac.be/wiki/page_simple' page = urlopen(site_url) print(page) # page est un objet urllib html_bytes = page.read() html = html_bytes.decode("utf-8") # html …

Didier Villers, UMONS - wiki teaching:progappchim

teaching:progappchim:algos_divers

teaching:progappchim:algos_entiers

teaching:progappchim:algos_graphes

teaching:progappchim:altair_simple

teaching:progappchim:analyse_images

teaching:progappchim:attracteur_lorenz

teaching:progappchim:bioinformatic

teaching:progappchim:bokeh_simple